More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2091 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  100 
 
 
332 aa  662    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  60.06 
 
 
326 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  55.62 
 
 
329 aa  378  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  56.11 
 
 
329 aa  351  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  56.02 
 
 
330 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  54.22 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  53.92 
 
 
330 aa  334  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  53.77 
 
 
328 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  54.07 
 
 
330 aa  328  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  42.07 
 
 
331 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  43.67 
 
 
334 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  44.48 
 
 
345 aa  225  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  38.97 
 
 
332 aa  220  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  35.76 
 
 
365 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  39.41 
 
 
364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  35.1 
 
 
361 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  37.25 
 
 
362 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  34.77 
 
 
361 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  34.77 
 
 
361 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  34.44 
 
 
361 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  35.29 
 
 
335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  38.33 
 
 
363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  34.89 
 
 
332 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  35.74 
 
 
353 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  34.08 
 
 
361 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  34.41 
 
 
361 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  34.41 
 
 
361 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  37.42 
 
 
366 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  35.48 
 
 
357 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  34.62 
 
 
364 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  36.3 
 
 
350 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  35.62 
 
 
370 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  35.97 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  34.45 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  36.21 
 
 
353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  36.96 
 
 
353 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  35.64 
 
 
370 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  36.42 
 
 
353 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  33.99 
 
 
363 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  35.31 
 
 
350 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  33.66 
 
 
363 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  34.66 
 
 
338 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  34.65 
 
 
348 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  33.12 
 
 
363 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  34.03 
 
 
367 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  31.48 
 
 
329 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  33.33 
 
 
372 aa  149  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  34.21 
 
 
303 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  31.17 
 
 
331 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  31.6 
 
 
361 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  33.91 
 
 
363 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  32.75 
 
 
351 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  32.75 
 
 
365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  29.19 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  29.55 
 
 
335 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  29.97 
 
 
335 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  29.55 
 
 
335 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  29.55 
 
 
335 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  29.01 
 
 
335 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  27.78 
 
 
332 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  26.57 
 
 
332 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3446  catalase  31.46 
 
 
715 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0935756  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  27.08 
 
 
332 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  28.18 
 
 
511 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  29.11 
 
 
332 aa  96.3  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3057  catalase  27.57 
 
 
458 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3201  catalase  30.46 
 
 
715 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.975067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3059  catalase  26.76 
 
 
458 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.064434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2764  catalase  27.06 
 
 
459 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3024  catalase  27.06 
 
 
459 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0344  catalase-2  26.44 
 
 
676 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  28.52 
 
 
510 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2747  catalase  26.76 
 
 
458 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0967809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4605  catalase  26.44 
 
 
675 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2816  catalase  26.76 
 
 
459 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0110804  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3030  catalase  26.76 
 
 
459 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  26.9 
 
 
488 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  27.84 
 
 
511 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  27.84 
 
 
511 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  27.84 
 
 
511 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  27.61 
 
 
459 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  26.9 
 
 
449 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2820  catalase  28.19 
 
 
459 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0875  catalase  25.85 
 
 
707 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0403513  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08637  Catalase A (EC 1.11.1.6)(Spore-specific catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55305]  28.23 
 
 
744 aa  91.3  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139422  normal  0.87889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  26.55 
 
 
488 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  27.55 
 
 
684 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  28.18 
 
 
510 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  27.55 
 
 
713 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  26.9 
 
 
488 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  26.55 
 
 
488 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  26.55 
 
 
488 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  26.55 
 
 
488 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  26.55 
 
 
488 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  26.55 
 
 
488 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  27.7 
 
 
529 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1029  Catalase  27.7 
 
 
682 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  27.34 
 
 
507 aa  90.1  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  25.86 
 
 
488 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  27.61 
 
 
459 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>