More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0689 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 397 aa  820    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  44.81 
 
 		 385 aa  343  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  42.17 
 
 		 406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  46.63 
 
 		 394 aa  323  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  42.12 
 
 		 404 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3259  glycosyl transferase group 1  39.69 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115227  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6297  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 		 400 aa  256  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.223266 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  29.41 
 
 		 415 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  28.07 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 389 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  27.09 
 
 		 391 aa  133  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.87 
 
 		 383 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 388 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.81 
 
 		 398 aa  123  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.81 
 
 		 398 aa  123  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 384 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 384 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 395 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 377 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  30.56 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  23.53 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.49 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.86 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2072  group 1 glycosyl transferase  28.61 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13881  hypothetical protein  22.4 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.812309  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  36.76 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  32.59 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  24.14 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.51 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  30.65 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5790  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  34.25 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  35.11 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2102  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072579  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.55 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0510  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  33.99 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  33.01 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  21.89 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  27.6 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2751  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  27.49 
 
 		 480 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  23.88 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  27.68 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.88 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>