152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2154 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  46.6 
 
 		 784 aa  661    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  49.36 
 
 		 794 aa  744    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  47.73 
 
 		 785 aa  699    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  48.28 
 
 		 783 aa  711    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  47.42 
 
 		 786 aa  694    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  100 
 
 		 783 aa  1594    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  45.91 
 
 		 781 aa  696    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1060  DNA-directed DNA polymerase  39.82 
 
 		 764 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.474491  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  29.14 
 
 		 780 aa  314  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  28.5 
 
 		 780 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  29.17 
 
 		 781 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  28.57 
 
 		 941 aa  284  5.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  27.26 
 
 		 811 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  29.52 
 
 		 932 aa  281  4e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  29.47 
 
 		 810 aa  278  3e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  26.91 
 
 		 910 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  31.3 
 
 		 607 aa  246  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  29.41 
 
 		 784 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  28.18 
 
 		 812 aa  233  9e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  27.44 
 
 		 982 aa  233  9e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  27.9 
 
 		 1058 aa  224  3e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  29.09 
 
 		 1070 aa  215  2.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  26.25 
 
 		 818 aa  211  6e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  25.14 
 
 		 1087 aa  209  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  26.89 
 
 		 912 aa  207  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  27.36 
 
 		 796 aa  206  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  28.54 
 
 		 795 aa  206  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  27.86 
 
 		 1044 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  28.94 
 
 		 821 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  27.63 
 
 		 929 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  26.35 
 
 		 882 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  26.42 
 
 		 877 aa  177  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  26.62 
 
 		 835 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  27.66 
 
 		 787 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  27.01 
 
 		 990 aa  173  9e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  27.75 
 
 		 786 aa  173  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  27.58 
 
 		 794 aa  170  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  24.15 
 
 		 787 aa  167  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  25.65 
 
 		 853 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  26.24 
 
 		 1463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  26.74 
 
 		 852 aa  165  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  27.52 
 
 		 789 aa  162  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  25.49 
 
 		 816 aa  160  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  28.11 
 
 		 790 aa  156  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  31.7 
 
 		 1353 aa  156  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6015  DNA polymerase II  25.48 
 
 		 795 aa  156  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  26.02 
 
 		 786 aa  156  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  25.82 
 
 		 787 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  25.1 
 
 		 853 aa  154  7e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  26.68 
 
 		 788 aa  154  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  25.59 
 
 		 783 aa  153  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  25.59 
 
 		 783 aa  153  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  25.59 
 
 		 783 aa  153  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  25.59 
 
 		 783 aa  153  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  25.59 
 
 		 783 aa  153  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  25.28 
 
 		 786 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  25.28 
 
 		 786 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  24.69 
 
 		 782 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  25.45 
 
 		 783 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  25.35 
 
 		 786 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  25.24 
 
 		 816 aa  151  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  25.45 
 
 		 783 aa  151  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  26.2 
 
 		 787 aa  151  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  25.45 
 
 		 783 aa  150  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  25.66 
 
 		 783 aa  150  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  26.21 
 
 		 792 aa  150  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  25.28 
 
 		 791 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  24.28 
 
 		 854 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  26.29 
 
 		 787 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  24.09 
 
 		 854 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  24.8 
 
 		 783 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  25.15 
 
 		 787 aa  148  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  23.97 
 
 		 871 aa  147  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  24.8 
 
 		 783 aa  147  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  24.8 
 
 		 783 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  24.8 
 
 		 783 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  23.88 
 
 		 788 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  25.85 
 
 		 809 aa  145  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  24.66 
 
 		 787 aa  145  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  25.1 
 
 		 791 aa  145  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  23.45 
 
 		 793 aa  144  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  25.86 
 
 		 789 aa  144  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  25.58 
 
 		 788 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1412  DNA polymerase B region  26.22 
 
 		 785 aa  142  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  23.77 
 
 		 794 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  24.96 
 
 		 788 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  23.77 
 
 		 794 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3264  DNA polymerase I  28.02 
 
 		 716 aa  140  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  24.61 
 
 		 818 aa  140  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  25.17 
 
 		 794 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  25 
 
 		 1459 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  24.04 
 
 		 1485 aa  139  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  25.24 
 
 		 786 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  25.36 
 
 		 790 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  24.96 
 
 		 808 aa  135  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  24.87 
 
 		 790 aa  135  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  25.67 
 
 		 820 aa  135  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  25.57 
 
 		 793 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  25.28 
 
 		 788 aa  134  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  23.87 
 
 		 797 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>