More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0431 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0431  pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 321 aa  657    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0638  Pyruvate, water dikinase  46.45 
 
 		 312 aa  278  7e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  39.63 
 
 		 779 aa  204  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  37.89 
 
 		 794 aa  199  7e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.64 
 
 		 887 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  37.35 
 
 		 810 aa  181  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  36.73 
 
 		 809 aa  181  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  38.02 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  37.58 
 
 		 824 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  36.48 
 
 		 781 aa  178  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  35.83 
 
 		 788 aa  176  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  35.74 
 
 		 754 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  35.2 
 
 		 762 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  36.06 
 
 		 799 aa  172  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  36.45 
 
 		 812 aa  172  9e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  35.76 
 
 		 785 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 769 aa  169  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  33.77 
 
 		 758 aa  170  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  36.02 
 
 		 809 aa  169  5e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  34.37 
 
 		 764 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  36.21 
 
 		 762 aa  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  35.44 
 
 		 780 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  34.84 
 
 		 760 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  32.83 
 
 		 782 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  34.98 
 
 		 761 aa  163  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  33.86 
 
 		 865 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  35.42 
 
 		 785 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.12 
 
 		 891 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  30.5 
 
 		 758 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  29.97 
 
 		 758 aa  160  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  30.5 
 
 		 758 aa  159  8e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  34.32 
 
 		 761 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  33.88 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  34.9 
 
 		 825 aa  156  6e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  32.72 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  31.45 
 
 		 758 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  30.5 
 
 		 758 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.24 
 
 		 810 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  32.69 
 
 		 870 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  33.54 
 
 		 808 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  33.54 
 
 		 853 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  32.19 
 
 		 890 aa  149  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  33.55 
 
 		 907 aa  149  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  30.82 
 
 		 758 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.97 
 
 		 840 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  32.91 
 
 		 790 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 791 aa  146  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  29.87 
 
 		 869 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.65 
 
 		 873 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  30.7 
 
 		 869 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  31 
 
 		 868 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.49 
 
 		 869 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  31.46 
 
 		 868 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  33.23 
 
 		 789 aa  143  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  33.54 
 
 		 760 aa  142  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  32.5 
 
 		 795 aa  142  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  30.94 
 
 		 891 aa  142  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  32.93 
 
 		 795 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  33.23 
 
 		 789 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  30.67 
 
 		 794 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  33.54 
 
 		 796 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  32.81 
 
 		 789 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  31.82 
 
 		 795 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  32.01 
 
 		 792 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  32.23 
 
 		 791 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  33.23 
 
 		 789 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  32.01 
 
 		 791 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  33.23 
 
 		 789 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  29.65 
 
 		 868 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  31.8 
 
 		 801 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  32.43 
 
 		 794 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  31 
 
 		 794 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  32.26 
 
 		 364 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  29.97 
 
 		 868 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  33.23 
 
 		 796 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  34.48 
 
 		 835 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  33.54 
 
 		 797 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  32.59 
 
 		 790 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  34.17 
 
 		 806 aa  139  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  28.48 
 
 		 866 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  29.25 
 
 		 868 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  31.71 
 
 		 794 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 789 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  29.25 
 
 		 868 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  31.93 
 
 		 791 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  31.1 
 
 		 790 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  32.91 
 
 		 971 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  31.93 
 
 		 791 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  31.1 
 
 		 791 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  32.1 
 
 		 792 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  31.93 
 
 		 791 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  31.63 
 
 		 805 aa  138  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  32.81 
 
 		 790 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  29.04 
 
 		 757 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  29.75 
 
 		 868 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  31.63 
 
 		 790 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  31.03 
 
 		 791 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  32.92 
 
 		 789 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.18 
 
 		 950 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  32.92 
 
 		 789 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>