More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0385 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0385  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
250 aa  493  9.999999999999999e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0433  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.23 
 
 
249 aa  278  6e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 
257 aa  168  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
280 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 
263 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  39.6 
 
 
263 aa  165  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  37.35 
 
 
263 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  37.6 
 
 
261 aa  159  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
264 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
262 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 
263 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
266 aa  156  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  41.13 
 
 
261 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
263 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.95 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  35.46 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
263 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 
270 aa  151  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
263 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 
265 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
263 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 
263 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  35.91 
 
 
261 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 
259 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 
260 aa  148  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
270 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2188  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 
255 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 
265 aa  145  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 
276 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 
255 aa  145  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
260 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
284 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
263 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  36.05 
 
 
261 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
266 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 
264 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 
265 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 
258 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
259 aa  138  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  38.96 
 
 
263 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 
257 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 
270 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
260 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.82 
 
 
266 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  36.4 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 
267 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
267 aa  135  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  36.69 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
266 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
258 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
260 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
266 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
273 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 
256 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  36.33 
 
 
663 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.14 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
261 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 
257 aa  131  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.02 
 
 
651 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  32.27 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
263 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 
263 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.66 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.52 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 
263 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
256 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 
274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.89 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.44 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  39.59 
 
 
258 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  36.69 
 
 
263 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 
262 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
267 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0903  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 
270 aa  125  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.048792  normal  0.959739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
261 aa  125  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
259 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  37.96 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 
261 aa  125  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>