More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2400 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2400  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 		 338 aa  677    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1361  Homoserine dehydrogenase  58.7 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.294507  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0610  homoserine dehydrogenase  50.62 
 
 		 320 aa  279  4e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.123069 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1218  homoserine dehydrogenase  39.77 
 
 		 440 aa  206  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  38.18 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  38.18 
 
 		 431 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 		 431 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 		 431 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 		 431 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 		 417 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 		 431 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 		 417 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 		 431 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  39.75 
 
 		 432 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 		 431 aa  199  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2173  homoserine dehydrogenase  40.97 
 
 		 441 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.785013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  36 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11401  homoserine dehydrogenase  39.69 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.814686 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0882  homoserine dehydrogenase  40.19 
 
 		 427 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00444587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1199  homoserine dehydrogenase  41.74 
 
 		 448 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08881  homoserine dehydrogenase  38.77 
 
 		 438 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1281  Homoserine dehydrogenase  43.03 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0445091  normal  0.213455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1744  homoserine dehydrogenase  42.04 
 
 		 441 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0702  homoserine dehydrogenase  37.91 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1165  homoserine dehydrogenase  38.73 
 
 		 430 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  40.41 
 
 		 437 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  38.12 
 
 		 431 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15361  homoserine dehydrogenase  37.54 
 
 		 440 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2222  Homoserine dehydrogenase  41.32 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.212971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  36.91 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2235  homoserine dehydrogenase  37.83 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1638  homoserine dehydrogenase  41.32 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  36.56 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2310  Homoserine dehydrogenase  41.32 
 
 		 441 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1901  Homoserine dehydrogenase  40.25 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  39.69 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0290  homoserine dehydrogenase  35.44 
 
 		 428 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000435351  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0704  homoserine dehydrogenase  40.97 
 
 		 435 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  42.41 
 
 		 435 aa  182  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  36.79 
 
 		 431 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 		 431 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2465  Homoserine dehydrogenase  42.54 
 
 		 439 aa  182  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.202426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  36.16 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  36.28 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  36.16 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4567  homoserine dehydrogenase  35.83 
 
 		 434 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  35.33 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  36.59 
 
 		 431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4153  Homoserine dehydrogenase  42.95 
 
 		 430 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.302378  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1957  homoserine dehydrogenase  41.87 
 
 		 435 aa  179  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  37.03 
 
 		 432 aa  180  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  36.16 
 
 		 431 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3041  homoserine dehydrogenase  38.49 
 
 		 432 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  38.39 
 
 		 438 aa  179  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1929  Homoserine dehydrogenase  38.61 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  36.98 
 
 		 429 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  40.13 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  38.61 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1964  Homoserine dehydrogenase  38.92 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.052998  hitchhiker  0.000903796 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1307  homoserine dehydrogenase  39.39 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.336564 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  36.68 
 
 		 436 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  36.14 
 
 		 441 aa  176  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1251  homoserine dehydrogenase  36.42 
 
 		 438 aa  176  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000453737  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11571  homoserine dehydrogenase  34.97 
 
 		 433 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.292612  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11561  homoserine dehydrogenase  34.04 
 
 		 433 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  39.49 
 
 		 428 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19340  homoserine dehydrogenase  36.79 
 
 		 455 aa  175  9e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3678  homoserine dehydrogenase  38.12 
 
 		 438 aa  175  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3882  homoserine dehydrogenase  40.06 
 
 		 445 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.5608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1144  homoserine dehydrogenase  37.9 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.233501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2311  homoserine dehydrogenase  36.71 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  38.1 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3896  homoserine dehydrogenase  40.06 
 
 		 445 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3970  homoserine dehydrogenase  40.06 
 
 		 445 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  36.76 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1389  homoserine dehydrogenase  35.83 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000156596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2424  homoserine dehydrogenase  40.75 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.167017  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  39.49 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2998  homoserine dehydrogenase  37.39 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.49984  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1416  homoserine dehydrogenase  35.83 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000188311  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1075  homoserine dehydrogenase  35.87 
 
 		 408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000110066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  35.96 
 
 		 427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4033  homoserine dehydrogenase  40.06 
 
 		 437 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1005  homoserine dehydrogenase  38.99 
 
 		 439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2094  homoserine dehydrogenase  39.02 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.547464  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  34.89 
 
 		 436 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0799  homoserine dehydrogenase  36.67 
 
 		 432 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1366  Homoserine dehydrogenase  33.83 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0291  homoserine dehydrogenase  34.73 
 
 		 438 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2164  homoserine dehydrogenase  37.89 
 
 		 428 aa  172  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0414769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  36.16 
 
 		 439 aa  172  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1551  homoserine dehydrogenase  35.45 
 
 		 439 aa  172  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0669  Homoserine dehydrogenase  34.28 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3939  Homoserine dehydrogenase  42.25 
 
 		 437 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0827  homoserine dehydrogenase  36.36 
 
 		 432 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1546  homoserine dehydrogenase  33.23 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>