More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2397 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  75.21 
 
 		 594 aa  900    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 598 aa  1221    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  54.11 
 
 		 616 aa  660    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  41.75 
 
 		 614 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  41.64 
 
 		 588 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  39.23 
 
 		 604 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  40.84 
 
 		 624 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  37.87 
 
 		 607 aa  412  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  40.38 
 
 		 641 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  40.23 
 
 		 613 aa  412  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  41.79 
 
 		 622 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  38.4 
 
 		 685 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.79 
 
 		 625 aa  398  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  39.38 
 
 		 591 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  40.03 
 
 		 611 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 628 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  36.07 
 
 		 620 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  36.07 
 
 		 620 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  36.75 
 
 		 619 aa  383  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  35.42 
 
 		 613 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  36.45 
 
 		 616 aa  383  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  39.01 
 
 		 590 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  37.63 
 
 		 607 aa  379  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.85 
 
 		 615 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  37.79 
 
 		 607 aa  381  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  37.48 
 
 		 601 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 594 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 594 aa  379  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 594 aa  379  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  36.74 
 
 		 607 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 594 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 594 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 594 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  37.33 
 
 		 594 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  37 
 
 		 594 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  36.1 
 
 		 638 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  37.33 
 
 		 594 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  36.6 
 
 		 628 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  37 
 
 		 594 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  38.02 
 
 		 610 aa  369  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  37.29 
 
 		 653 aa  369  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  37.17 
 
 		 627 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  39.43 
 
 		 607 aa  369  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  37.44 
 
 		 617 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  36.56 
 
 		 596 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  37.44 
 
 		 617 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  36.53 
 
 		 627 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  35.21 
 
 		 644 aa  364  3e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  38.72 
 
 		 615 aa  362  9e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  36.88 
 
 		 613 aa  362  9e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0902  excinuclease ABC subunit C  35.14 
 
 		 658 aa  362  1e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.839452  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  34.39 
 
 		 594 aa  361  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  36.35 
 
 		 593 aa  361  2e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  39.43 
 
 		 614 aa  361  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  36.73 
 
 		 610 aa  360  5e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  36.81 
 
 		 665 aa  359  7e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  36.35 
 
 		 598 aa  359  7e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 		 593 aa  359  9e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 		 593 aa  359  9e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  37.12 
 
 		 621 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  36.88 
 
 		 593 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  37.96 
 
 		 609 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  37.12 
 
 		 627 aa  357  3.9999999999999996e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  34.77 
 
 		 631 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  36.46 
 
 		 669 aa  356  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  37.08 
 
 		 656 aa  356  7.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  36.56 
 
 		 595 aa  355  1e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0683  excinuclease ABC subunit C  36.09 
 
 		 557 aa  355  1e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  37.68 
 
 		 624 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  36.15 
 
 		 629 aa  354  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  37.25 
 
 		 610 aa  354  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  37.52 
 
 		 605 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  37.78 
 
 		 641 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0659  excinuclease ABC subunit C  36.38 
 
 		 557 aa  353  4e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  35.6 
 
 		 609 aa  353  5e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 		 610 aa  353  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 		 617 aa  353  7e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 		 617 aa  353  7e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  36.72 
 
 		 613 aa  353  7e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  38.99 
 
 		 626 aa  352  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  37.11 
 
 		 610 aa  351  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  35.16 
 
 		 628 aa  351  2e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  36.39 
 
 		 622 aa  351  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  37.11 
 
 		 610 aa  350  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  34.65 
 
 		 616 aa  350  4e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  37.11 
 
 		 610 aa  350  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  35.91 
 
 		 609 aa  350  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  37.11 
 
 		 610 aa  350  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  37.11 
 
 		 610 aa  350  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  36.26 
 
 		 619 aa  350  5e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  37.11 
 
 		 610 aa  350  6e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  37.79 
 
 		 617 aa  349  9e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2478  excinuclease ABC, C subunit  33.75 
 
 		 652 aa  348  1e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.446818  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  37.11 
 
 		 610 aa  348  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  36.29 
 
 		 610 aa  348  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  36.35 
 
 		 607 aa  346  8.999999999999999e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1854  excinuclease ABC subunit C  35.34 
 
 		 574 aa  345  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.971322  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  36.32 
 
 		 692 aa  345  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  36.05 
 
 		 608 aa  345  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  35.63 
 
 		 610 aa  345  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>