More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2350 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.74 
 
 
232 aa  256  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.286686  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0457321 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
237 aa  119  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.874533  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.912393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.114405  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
237 aa  112  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 
222 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.214682  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
260 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1577  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.14 
 
 
226 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.062462  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 
234 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
254 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.86 
 
 
231 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.86 
 
 
231 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 
234 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
225 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.379017  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.19 
 
 
244 aa  101  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134822  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7587  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
241 aa  101  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.9 
 
 
230 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
235 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 
235 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2100  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.86 
 
 
226 aa  99.4  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
247 aa  99  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
241 aa  98.6  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.64 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.89 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
250 aa  96.3  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.63 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
237 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.419442  unclonable  0.00000816972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.96 
 
 
234 aa  95.9  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3589  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
246 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377487  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.15 
 
 
251 aa  95.1  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 
248 aa  95.1  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.3 
 
 
258 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.49 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 
263 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 
263 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 
263 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 
263 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 
263 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0870  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.61 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
249 aa  92.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  28.9 
 
 
254 aa  92.8  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 
263 aa  92  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 
263 aa  92  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 
263 aa  92  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 
263 aa  92  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 
263 aa  92  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7169  short chain dehydrogenase  28.18 
 
 
233 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  28.69 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0911  short chain dehydrogenase  34.26 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  30.67 
 
 
263 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.35 
 
 
247 aa  90.9  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0732  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  30.54 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.43 
 
 
236 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  30.54 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  30.54 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.43 
 
 
236 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.157663  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.76 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0554  ribitol 2-dehydrogenase  27.92 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.33 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
250 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  30.21 
 
 
251 aa  89.4  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239235  normal  0.254296 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4854  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
236 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0657212  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4948  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.16 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
250 aa  89  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.29 
 
 
246 aa  89  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0268  ribitol dehydrogenase  28.33 
 
 
242 aa  89  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.245269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.19 
 
 
245 aa  89  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3805  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 
237 aa  89  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132901  hitchhiker  0.00346902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 
247 aa  89  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.79 
 
 
246 aa  88.6  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 
242 aa  88.6  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.87 
 
 
256 aa  88.6  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.485877  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
246 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.11 
 
 
251 aa  87.8  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0243  ribitol dehydrogenase  27.92 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
282 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
252 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0777  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.72 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
242 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1252  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.11 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0173112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>