291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1061 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  100 
 
 		 494 aa  977    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0768  cation transporter  64.69 
 
 		 473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.369941 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1060  cation transporter  58.87 
 
 		 495 aa  540  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  40.25 
 
 		 479 aa  340  4e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  38.19 
 
 		 478 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  36.98 
 
 		 524 aa  323  4e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  40.4 
 
 		 476 aa  322  7e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  38.66 
 
 		 483 aa  319  6e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  42.99 
 
 		 483 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  38.48 
 
 		 466 aa  312  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  40.08 
 
 		 505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  39.56 
 
 		 514 aa  303  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  40 
 
 		 479 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  36.04 
 
 		 510 aa  298  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  38.85 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  37.82 
 
 		 520 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  36 
 
 		 483 aa  286  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  40.29 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  34.68 
 
 		 482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  36.36 
 
 		 482 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1185  cation transporter  35.88 
 
 		 502 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000630162 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  38.3 
 
 		 478 aa  274  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  38.74 
 
 		 481 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  39.09 
 
 		 481 aa  272  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  36.59 
 
 		 498 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  35.71 
 
 		 483 aa  270  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  37.27 
 
 		 494 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  38.5 
 
 		 480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  36.34 
 
 		 485 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  37.84 
 
 		 481 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  34.99 
 
 		 491 aa  266  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  34.38 
 
 		 509 aa  266  7e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  39.06 
 
 		 483 aa  266  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  37.61 
 
 		 512 aa  263  6.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  35.51 
 
 		 482 aa  262  8.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  35.43 
 
 		 488 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  36.56 
 
 		 482 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3474  cation transporter  38.21 
 
 		 514 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0877614  normal  0.0193815 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1184  cation transporter  37.48 
 
 		 512 aa  257  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.543653  hitchhiker  0.000000321699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1412  cation transporter  34.77 
 
 		 516 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  36.45 
 
 		 482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  38.3 
 
 		 488 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  38.3 
 
 		 488 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  31.4 
 
 		 485 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  32.67 
 
 		 483 aa  249  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  33.09 
 
 		 481 aa  249  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  34.55 
 
 		 491 aa  249  8e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.08 
 
 		 483 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  32.85 
 
 		 481 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  35.15 
 
 		 488 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  32.85 
 
 		 486 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  36.41 
 
 		 483 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  34.12 
 
 		 474 aa  244  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  34.75 
 
 		 487 aa  244  3e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  31.58 
 
 		 480 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  32.13 
 
 		 481 aa  243  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  34.68 
 
 		 498 aa  243  6e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  34.89 
 
 		 486 aa  243  7e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  35.71 
 
 		 485 aa  243  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  33.83 
 
 		 488 aa  242  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.15 
 
 		 485 aa  242  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  33.57 
 
 		 486 aa  242  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  34.89 
 
 		 485 aa  242  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  35.46 
 
 		 485 aa  242  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  36.39 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  34.12 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  34.52 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  34.74 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  34.52 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  34.6 
 
 		 477 aa  239  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  32.52 
 
 		 484 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  36.45 
 
 		 483 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  35.93 
 
 		 485 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  33.18 
 
 		 484 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  33.75 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  36.39 
 
 		 485 aa  236  8e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  32.3 
 
 		 484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  31.97 
 
 		 482 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  32.13 
 
 		 481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  33.33 
 
 		 485 aa  234  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  33.42 
 
 		 482 aa  234  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  34.51 
 
 		 485 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  33.56 
 
 		 485 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  33.56 
 
 		 485 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  33.56 
 
 		 485 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  33.56 
 
 		 485 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  31.36 
 
 		 480 aa  232  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  31.78 
 
 		 485 aa  232  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  34.58 
 
 		 483 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  32.37 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  32.13 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  34.58 
 
 		 483 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  34.58 
 
 		 483 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  34.58 
 
 		 483 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  34.58 
 
 		 483 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  31.8 
 
 		 484 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  29.84 
 
 		 480 aa  230  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  34.27 
 
 		 485 aa  230  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  33.33 
 
 		 466 aa  229  7e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  32.67 
 
 		 483 aa  229  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>