65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0064 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  493  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  55.56 
 
 
240 aa  268  7e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0250  hypothetical protein  38.8 
 
 
238 aa  139  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0479  protein of unknown function DUF164  27.02 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0496  protein of unknown function DUF164  27.02 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0563349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3301  hypothetical protein  24.07 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.26 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3987  hypothetical protein  29.6 
 
 
238 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0445  hypothetical protein  27.94 
 
 
237 aa  62.4  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0400  hypothetical protein  26.98 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1251  protein of unknown function DUF164  25 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2149  hypothetical protein  22.92 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0682  protein of unknown function DUF164  23.65 
 
 
241 aa  58.5  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1728  hypothetical protein  21.85 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.782306  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1437  hypothetical protein  24.41 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1136  protein of unknown function DUF164  24.37 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  27.56 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  30.52 
 
 
237 aa  55.5  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3081  hypothetical protein  32.18 
 
 
116 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  24.58 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  24.27 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  30.46 
 
 
245 aa  52.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0540  protein of unknown function DUF164  25.52 
 
 
245 aa  52.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  28.69 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  30.65 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0672  hypothetical protein  21.77 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000625535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2676  hypothetical protein  23.17 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1258  protein of unknown function DUF164  23.57 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628919  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  22.78 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  24.07 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1209  hypothetical protein  24.35 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  24.4 
 
 
245 aa  49.3  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  25.83 
 
 
245 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  25.83 
 
 
245 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  25.83 
 
 
245 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  28.95 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  32.9 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06960  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  27.85 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.446432 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0763  hypothetical protein  22.13 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0264038  normal  0.723487 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  25.81 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  23.36 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  26.53 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0722  hypothetical protein  26.8 
 
 
262 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69531  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  28.57 
 
 
247 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  31.3 
 
 
242 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  21.72 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0030  protein of unknown function DUF164  26.15 
 
 
237 aa  45.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.372123  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1045  hypothetical protein  24.82 
 
 
237 aa  45.8  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  29.69 
 
 
245 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0759  protein of unknown function DUF164  25.77 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0759  protein of unknown function DUF164  25.77 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  31.25 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0706  hypothetical protein  25.37 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.735937  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1300  hypothetical protein  25.56 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0806  hypothetical protein  25.56 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0729  hypothetical protein  25.56 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206573  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  25.2 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  24.69 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0258  protein of unknown function DUF164  20 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00469594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  25.51 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  25.66 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0733  protein of unknown function DUF164  24.39 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0821562  normal  0.949915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  31.3 
 
 
246 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1347  hypothetical protein  21.5 
 
 
275 aa  42.4  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  34.67 
 
 
245 aa  42  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>