43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5557 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1158    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  32.33 
 
 		 518 aa  220  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  31.67 
 
 		 562 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  29.29 
 
 		 500 aa  187  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  29.83 
 
 		 549 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  29.6 
 
 		 520 aa  171  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  26.4 
 
 		 605 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 		 436 aa  134  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2796  hypothetical protein  46.96 
 
 		 135 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  23.89 
 
 		 568 aa  91.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  28.01 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  24.66 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  34.15 
 
 		 602 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  23.5 
 
 		 605 aa  74.7  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  25.36 
 
 		 456 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  23.24 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  34.18 
 
 		 435 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1104  von Willebrand factor, type A  28.51 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  26.6 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  30.36 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  38.82 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  28.66 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  25.93 
 
 		 666 aa  56.6  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  26.88 
 
 		 431 aa  55.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2738  von Willebrand factor type A  34.09 
 
 		 419 aa  54.3  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  27.38 
 
 		 435 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  25 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  24.32 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2368  von Willebrand factor, type A  27.23 
 
 		 402 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0012043  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  27.39 
 
 		 462 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  29.22 
 
 		 432 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  26.75 
 
 		 443 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  38.67 
 
 		 582 aa  50.8  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  28.29 
 
 		 566 aa  50.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  26.15 
 
 		 553 aa  50.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  26.34 
 
 		 566 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5624  hypothetical protein  38.36 
 
 		 359 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542245  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  42.86 
 
 		 390 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  27.33 
 
 		 477 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0838  hypothetical protein  31.58 
 
 		 563 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.296759  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3648  hypothetical protein  33.33 
 
 		 400 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  22.99 
 
 		 511 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>