87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3491 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  100 
 
 
177 aa  354  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  88.73 
 
 
190 aa  265  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0591  invasion associated locus B family protein  85.14 
 
 
180 aa  263  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.04899  normal  0.0705268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  85.71 
 
 
166 aa  260  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0602  Invasion associated locus B family protein  76.67 
 
 
180 aa  258  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.100157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  85.61 
 
 
166 aa  249  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  66.87 
 
 
213 aa  227  7e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  69.86 
 
 
185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  63.37 
 
 
182 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  66.9 
 
 
190 aa  209  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  60.23 
 
 
203 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  64.29 
 
 
211 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  59.88 
 
 
186 aa  207  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  63.35 
 
 
195 aa  207  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  65.97 
 
 
214 aa  204  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  64.54 
 
 
191 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  61.27 
 
 
213 aa  187  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  61.27 
 
 
213 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  60 
 
 
172 aa  185  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  60.71 
 
 
208 aa  184  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  60.71 
 
 
198 aa  184  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  60 
 
 
204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  58.74 
 
 
176 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  46.76 
 
 
242 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0404  invasion associated locus B family protein  36.03 
 
 
179 aa  111  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1615  hypothetical protein  31.69 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338894 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1222  invasion associated locus B  32.88 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  28.95 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1381  invasion associated locus B family protein  33.11 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0695092  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5774  Invasion associated locus B family protein  27.18 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.295733 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2026  invasion associated locus B  32.52 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.201863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3094  invasion associated locus B family protein  27.01 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.40204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1039  invasion associated locus B family protein  30.77 
 
 
220 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0356  invasion protein B  29.41 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  30.09 
 
 
204 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3104  invasion associated locus B family protein  27.27 
 
 
233 aa  55.1  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2778  hypothetical protein  28.67 
 
 
222 aa  54.7  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1420  invasion associated locus B family protein  28.67 
 
 
222 aa  54.7  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  28.89 
 
 
187 aa  54.7  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  28.15 
 
 
251 aa  54.3  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  29.47 
 
 
205 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  25.29 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  29.73 
 
 
205 aa  52.4  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0778  invasion associated locus B family protein  25.83 
 
 
187 aa  52  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000182152  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  28.95 
 
 
205 aa  51.2  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0942  hypothetical protein  34.96 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1977  Invasion associated locus B family protein  29.17 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1179  invasion associated locus B family protein  27.66 
 
 
172 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  25.37 
 
 
267 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  25.37 
 
 
267 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  24.63 
 
 
267 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0726  invasion associated locus B  30.82 
 
 
207 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5784  invasion associated locus B family protein  24.32 
 
 
205 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339896  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2149  invasion associated family protein  24 
 
 
225 aa  48.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.838486  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0304  putative invasion protein B  24.48 
 
 
204 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  25.44 
 
 
209 aa  47.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1390  invasion associated locus B family protein  24.2 
 
 
182 aa  47.8  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.931817  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  24.42 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4264  invasion associated locus B  23.13 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.536933  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5187  Invasion protein B  23.78 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3761  invasion associated locus B family protein  29.58 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  29.76 
 
 
221 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  28.57 
 
 
219 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  26.67 
 
 
186 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0483  invasion associated locus B family protein  22.77 
 
 
209 aa  45.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.269225  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5547  Invasion associated locus B family protein  27.59 
 
 
169 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.572174  hitchhiker  0.000199147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  25.53 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2942  Invasion associated locus B family protein  23.47 
 
 
248 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  20.59 
 
 
250 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0588  invasion associated locus B  22.79 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223596  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  19.85 
 
 
244 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  24.77 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7180  Invasion associated locus B family protein  27.4 
 
 
260 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0450  hypothetical protein  29.82 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0800  invasion associated locus B family protein  20.75 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6313  invasion associated locus B family protein  28.79 
 
 
253 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2982  hypothetical protein  28.95 
 
 
170 aa  42  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4824  invasion associated locus B family protein  25.26 
 
 
225 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0332961 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2110  hypothetical protein  28.95 
 
 
170 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0255  hypothetical protein  28.95 
 
 
170 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0267  hypothetical protein  28.95 
 
 
170 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3312  hypothetical protein  28.95 
 
 
170 aa  42  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3366  hypothetical protein  28.95 
 
 
170 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2614  invasion associated locus B  21.43 
 
 
253 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0807457  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0231  hypothetical protein  28.95 
 
 
170 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1701  Invasion associated locus B family protein  28.42 
 
 
212 aa  40.8  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1210  Invasion associated locus B family protein  27.46 
 
 
188 aa  40.8  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>