More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1001 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4144  prolyl-tRNA synthetase  81.55 
 
 		 443 aa  756    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0822  prolyl-tRNA synthetase  71.79 
 
 		 442 aa  646    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.912404  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3276  prolyl-tRNA synthetase  68.79 
 
 		 438 aa  635    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1066  prolyl-tRNA synthetase  97.28 
 
 		 441 aa  883    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1001  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 441 aa  899    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0568909 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2405  prolyl-tRNA synthetase  71.33 
 
 		 442 aa  647    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309305  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1797  prolyl-tRNA synthetase  71.16 
 
 		 439 aa  639    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.605201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1279  prolyl-tRNA synthetase  69.46 
 
 		 440 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193601  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0918  prolyl-tRNA synthetase  68.3 
 
 		 442 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2041  prolyl-tRNA synthetase  85.71 
 
 		 441 aa  790    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4463  prolyl-tRNA synthetase  73.58 
 
 		 440 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1371  prolyl-tRNA synthetase  70.16 
 
 		 440 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2597  prolyl-tRNA synthetase  69.02 
 
 		 439 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.700725  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1739  prolyl-tRNA synthetase  70.4 
 
 		 498 aa  649    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350453  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4408  prolyl-tRNA synthetase  82.27 
 
 		 444 aa  764    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.619461  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2812  prolyl-tRNA synthetase  70.56 
 
 		 445 aa  639    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2865  prolyl-tRNA synthetase  69.02 
 
 		 439 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1040  prolyl-tRNA synthetase  71.92 
 
 		 442 aa  672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0816  prolyl-tRNA synthetase  71.86 
 
 		 442 aa  650    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1196  prolyl-tRNA synthetase  97.05 
 
 		 441 aa  882    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2427  prolyl-tRNA synthetase  68.79 
 
 		 439 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0696264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0701  prolyl-tRNA synthetase  69.53 
 
 		 440 aa  627  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1865  prolyl-tRNA synthetase  68.56 
 
 		 439 aa  624  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102864  normal  0.0772864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2197  prolyl-tRNA synthetase  68.11 
 
 		 439 aa  624  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4531  prolyl-tRNA synthetase  66.74 
 
 		 444 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3205  prolyl-tRNA synthetase  67.88 
 
 		 439 aa  623  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0794  prolyl-tRNA synthetase  68.07 
 
 		 441 aa  624  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1576  prolyl-tRNA synthetase  70.77 
 
 		 435 aa  620  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.710694  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1375  prolyl-tRNA synthetase  67.58 
 
 		 444 aa  616  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.178803  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1299  prolyl-tRNA synthetase  61.9 
 
 		 450 aa  595  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0744  prolyl-tRNA synthetase  62.79 
 
 		 445 aa  585  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2347  prolyl-tRNA synthetase  66.59 
 
 		 437 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0778  prolyl-tRNA synthetase  62.47 
 
 		 445 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1852  prolyl-tRNA synthetase  61.42 
 
 		 451 aa  580  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2434  prolyl-tRNA synthetase  62.47 
 
 		 445 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969516  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0401  prolyl-tRNA synthetase  62 
 
 		 445 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0939  prolyl-tRNA synthetase  62.64 
 
 		 437 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1060  prolyl-tRNA synthetase  61 
 
 		 452 aa  555  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3343  prolyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 		 438 aa  557  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0813  prolyl-tRNA synthetase  53.65 
 
 		 422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0327  prolyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 424 aa  433  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00684631  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0367  prolyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 436 aa  420  1e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0740  prolyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 424 aa  415  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.944832  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0860  prolyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0222231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  57.83 
 
 		 585 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 576 aa  286  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 573 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 573 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 564 aa  282  7.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 570 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 		 566 aa  282  8.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 574 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 568 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 		 570 aa  280  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 		 580 aa  280  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  57.47 
 
 		 570 aa  279  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  57.8 
 
 		 574 aa  279  7e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 573 aa  279  9e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  58.26 
 
 		 569 aa  279  9e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 		 584 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  58.26 
 
 		 571 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  57.47 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  56.11 
 
 		 571 aa  276  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  57.33 
 
 		 576 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 571 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 		 571 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 		 569 aa  276  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 571 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02965  prolyl-tRNA synthetase  56.11 
 
 		 572 aa  275  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 571 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51900  prolyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 571 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 571 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 571 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0280  prolyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 572 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.888152  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0269  prolyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 572 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.104419 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0264  prolyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 572 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.138448  normal  0.408227 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 569 aa  274  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0283  prolyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 572 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0264  prolyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 572 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 571 aa  273  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0732  prolyl-tRNA synthetase  55.95 
 
 		 572 aa  273  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.342161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 574 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 571 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 571 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 571 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 570 aa  272  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0205  prolyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 572 aa  272  9e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 571 aa  272  9e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3408  prolyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 572 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.132012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00192  hypothetical protein  55.51 
 
 		 572 aa  272  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3465  prolyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 572 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0875949  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 		 571 aa  272  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0198  prolyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 572 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0258989  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 570 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 570 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0201  prolyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 572 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00399222  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0188  prolyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 572 aa  272  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.638995  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 571 aa  271  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>