More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0656 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0656  flagellum-specific ATP synthase  100 
 
 
442 aa  857    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6505  flagellum-specific ATP synthase  85.31 
 
 
441 aa  705    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0693  flagellum-specific ATP synthase  96.15 
 
 
442 aa  828    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11066  normal  0.120741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0682  flagellum-specific ATP synthase  96.15 
 
 
442 aa  827    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  70.32 
 
 
439 aa  597  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1086  flagellum-specific ATP synthase  65.13 
 
 
443 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.794753  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1657  flagellum-specific ATP synthase  66.29 
 
 
449 aa  567  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2811  flagellum-specific ATP synthase  64.16 
 
 
442 aa  561  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4214  flagellum-specific ATP synthase  59.67 
 
 
452 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0120  flagellum-specific ATP synthase  60.14 
 
 
453 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0300  flagellum-specific ATP synthase  60.09 
 
 
465 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0347  flagellum-specific ATP synthase  57.6 
 
 
466 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0569948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0315  flagellum-specific ATP synthase  58.09 
 
 
465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0731  flagellum-specific ATP synthase  55.77 
 
 
464 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0253  flagellum-specific ATP synthase  56.97 
 
 
467 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.456391  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1145  flagellum-specific ATP synthase  52.51 
 
 
537 aa  442  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0129  flagellum-specific ATP synthase  54.72 
 
 
422 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  52.31 
 
 
450 aa  364  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  50.77 
 
 
451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  50.77 
 
 
451 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  50.38 
 
 
452 aa  354  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  48.4 
 
 
475 aa  352  5e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  46.93 
 
 
454 aa  350  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  47.72 
 
 
455 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  50.51 
 
 
453 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  46.55 
 
 
445 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  45.66 
 
 
440 aa  346  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  49.72 
 
 
441 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  49.09 
 
 
441 aa  342  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  50.72 
 
 
441 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  51.78 
 
 
451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  50.57 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  50.57 
 
 
441 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  51.56 
 
 
445 aa  331  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  51.7 
 
 
448 aa  323  5e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  41.63 
 
 
434 aa  322  7e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  51.72 
 
 
453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  50.16 
 
 
431 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  47.46 
 
 
439 aa  315  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  41.22 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  46.47 
 
 
441 aa  313  5.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0074  FliI/YscN family ATPase  42.72 
 
 
447 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  45.26 
 
 
439 aa  312  9e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  47.58 
 
 
433 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  44.58 
 
 
442 aa  311  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  49.11 
 
 
486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  45.39 
 
 
439 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1332  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  47.65 
 
 
436 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3246  flagellum-specific ATP synthase  44.42 
 
 
450 aa  310  4e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  51.06 
 
 
450 aa  309  5e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  42.79 
 
 
438 aa  309  8e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  49.84 
 
 
472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04976  flagellum-specific ATP synthase  41.86 
 
 
450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  50.89 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  52.66 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5100  ATPase FliI/YscN  48.16 
 
 
488 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.956813  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0080  FliI/YscN family ATPase  45.2 
 
 
445 aa  307  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  41.43 
 
 
427 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  41.18 
 
 
448 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3976  FliI/YscN family ATPase  47.02 
 
 
449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0553  ATPase FliI/YscN  49.09 
 
 
471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  48.9 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  44.94 
 
 
437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  48.02 
 
 
437 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0001  FliI/YscN family ATPase  46.93 
 
 
436 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3473  FliI/YscN family ATPase  46.73 
 
 
449 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.906241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  47.56 
 
 
489 aa  302  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  49.56 
 
 
441 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  49.11 
 
 
436 aa  300  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  45.62 
 
 
443 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  50.31 
 
 
478 aa  299  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2109  FliI/YscN family ATPase  43.94 
 
 
444 aa  299  8e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61014  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  41.21 
 
 
426 aa  298  9e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  46.99 
 
 
446 aa  298  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  43.31 
 
 
422 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  48.21 
 
 
442 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0174  flagellum-specific ATP synthase  44.87 
 
 
435 aa  297  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2394  flagellum-specific ATP synthase  46.97 
 
 
472 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.159626  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  46.07 
 
 
466 aa  297  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1526  type III secretion system ATPase  47.72 
 
 
433 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2599  FliI/YscN family ATPase  45.82 
 
 
436 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.882891  hitchhiker  0.000211715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  47.5 
 
 
435 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1511  type III secretion system ATPase  47.45 
 
 
433 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.612036  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  49.37 
 
 
464 aa  296  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  47.11 
 
 
445 aa  296  6e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  41.88 
 
 
446 aa  296  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  44.2 
 
 
436 aa  296  7e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6416  ATPase FliI/YscN  49.07 
 
 
519 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  47.11 
 
 
445 aa  295  8e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2293  flagellum-specific ATP synthase  46.82 
 
 
472 aa  295  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.673762  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  46.45 
 
 
480 aa  295  9e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1758  type III secretion system ATPase  47.45 
 
 
433 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00305605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2011  flagellum-specific ATP synthase  46.82 
 
 
484 aa  295  9e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  47.11 
 
 
445 aa  295  9e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  47.11 
 
 
445 aa  295  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  47.42 
 
 
445 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3064  flagellar protein export ATPase FliI  48.76 
 
 
524 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  47.42 
 
 
445 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  47.42 
 
 
445 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1928  type III secretion system ATPase  47.72 
 
 
443 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>