204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3565 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  407  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  42.08 
 
 
200 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  42.78 
 
 
179 aa  144  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  44.72 
 
 
222 aa  142  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  48.23 
 
 
294 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  45.39 
 
 
293 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  47.52 
 
 
283 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  46.81 
 
 
293 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  47.92 
 
 
282 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  46.1 
 
 
283 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  44.68 
 
 
283 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  45.39 
 
 
283 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.81 
 
 
279 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  47.41 
 
 
301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  46.94 
 
 
282 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  47.06 
 
 
299 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  45.83 
 
 
162 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  43.41 
 
 
320 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  40.99 
 
 
444 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  42.65 
 
 
458 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  45.3 
 
 
200 aa  104  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  43.41 
 
 
310 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  46.09 
 
 
286 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  43.12 
 
 
347 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  42.22 
 
 
465 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  38.52 
 
 
167 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  44.19 
 
 
288 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  43.7 
 
 
305 aa  95.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38 
 
 
443 aa  95.1  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  38.81 
 
 
222 aa  94.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  41.18 
 
 
317 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  33.88 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  36.76 
 
 
249 aa  91.7  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  43.51 
 
 
180 aa  91.7  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  38.82 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  37.59 
 
 
541 aa  90.1  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  41.04 
 
 
270 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  44.44 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
157 aa  89.4  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  39.55 
 
 
495 aa  89  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  39.86 
 
 
331 aa  89  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  38.71 
 
 
212 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  42.98 
 
 
338 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  40.3 
 
 
211 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  32.93 
 
 
254 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  45.54 
 
 
338 aa  85.1  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  37.59 
 
 
500 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  36.76 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  34.52 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  31.1 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  39.29 
 
 
264 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0992  SCP-like extracellular  31.85 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  39.58 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  30.14 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  30.14 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  30.14 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  30.14 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  30.14 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  30.14 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  30.14 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  40.26 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  30.14 
 
 
270 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  33.33 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  28.47 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  38.32 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0051  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.57 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000168583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  29.45 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3984  hypothetical protein  33.07 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4052  hypothetical protein  33.07 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  32.09 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  29.08 
 
 
283 aa  72  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3697  hypothetical protein  33.07 
 
 
336 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3849  hypothetical protein  33.07 
 
 
344 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3680  hypothetical protein  33.07 
 
 
344 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3952  hypothetical protein  33.07 
 
 
344 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4147  hypothetical protein  33.07 
 
 
344 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  31.45 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4039  hypothetical protein  32.28 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.784658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3764  SCP-like extracellular  32.28 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  28.77 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3153  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36.84 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2640  hypothetical protein  33.94 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0937186  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1235  SCP-like extracellular  34.65 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0683  SCP-like extracellular  34.65 
 
 
423 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1582  SCP-like extracellular  30 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  0.283076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  35.07 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2897  SCP-like extracellular  35.54 
 
 
279 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204847  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3523  Allergen V5/Tpx-1 related  34.25 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  37.82 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0892  SCP-like extracellular  32.84 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243289 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  33.33 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0140  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.65 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.697458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1200  hypothetical protein  33.96 
 
 
344 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  38.24 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  38.24 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.2 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5956  SCP-like extracellular  34.35 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2369  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  29.77 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2188  SCP-like extracellular  38.71 
 
 
298 aa  65.1  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>