91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1823 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1823  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  748    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.599232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0726  hypothetical protein  50.55 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.299364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2618  hypothetical protein  52.31 
 
 		 440 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2489  hypothetical protein  52.31 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.457254  normal  0.59095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2789  protein of unknown function DUF72  49.38 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0971015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2570  hypothetical protein  55.33 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5902  hypothetical protein  55.12 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.834599 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2594  hypothetical protein  55.33 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1959  hypothetical protein  55 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.479808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0715  hypothetical protein  52.3 
 
 		 505 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0023847  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0512  hypothetical protein  49.38 
 
 		 379 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204603  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1059  hypothetical protein  52.16 
 
 		 519 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.51988  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0105  hypothetical protein  52.16 
 
 		 522 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0559982  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0902  hypothetical protein  52.16 
 
 		 525 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0899  hypothetical protein  52.16 
 
 		 525 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103522  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2492  hypothetical protein  52.16 
 
 		 522 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000876051  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0657  hypothetical protein  52.16 
 
 		 522 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0357  hypothetical protein  52.16 
 
 		 522 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000555141  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3223  protein of unknown function DUF72  49.16 
 
 		 489 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.873397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0739  hypothetical protein  49.32 
 
 		 422 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1869  hypothetical protein  49.37 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1999  protein of unknown function DUF72  47.79 
 
 		 363 aa  266  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1704  hypothetical protein  47.94 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.792663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3371  hypothetical protein  46.74 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241512  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0715  protein of unknown function DUF72  47.02 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.0915207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0765  hypothetical protein  45.45 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.143157 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0785  protein of unknown function DUF72  47.19 
 
 		 361 aa  250  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.223922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2644  hypothetical protein  42.13 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0813  hypothetical protein  43.16 
 
 		 355 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0200  protein of unknown function DUF72  43.82 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1934  protein of unknown function DUF72  29.86 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.978403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3869  hypothetical protein  27.89 
 
 		 343 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0151783 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  29.39 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  28.9 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  29.57 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  28.9 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  28.65 
 
 		 261 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  25.18 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  29.35 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  28.92 
 
 		 277 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  26.1 
 
 		 249 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  31.68 
 
 		 270 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  26.6 
 
 		 268 aa  53.5  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  29.95 
 
 		 243 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  23.47 
 
 		 252 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  29.79 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  26.97 
 
 		 254 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  23.88 
 
 		 267 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  25.93 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  24.63 
 
 		 264 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  28.43 
 
 		 242 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  29.79 
 
 		 245 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  29.79 
 
 		 245 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  27.92 
 
 		 242 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  25.37 
 
 		 268 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  24.9 
 
 		 234 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  25.69 
 
 		 241 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  27.68 
 
 		 279 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  28.9 
 
 		 249 aa  50.4  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  24.88 
 
 		 265 aa  50.4  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  26.53 
 
 		 254 aa  50.4  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  29.73 
 
 		 259 aa  50.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  25.87 
 
 		 268 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  24.74 
 
 		 242 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  26.83 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  31.18 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  37.63 
 
 		 243 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  26.16 
 
 		 240 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  23.44 
 
 		 237 aa  47.8  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  22.71 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  25.13 
 
 		 267 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  24.37 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  31.54 
 
 		 282 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  28.39 
 
 		 254 aa  47  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  29.29 
 
 		 247 aa  46.6  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  28.79 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  27.61 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  22.12 
 
 		 268 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0190  hypothetical protein  32.56 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.665614  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  25.74 
 
 		 249 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9057  hypothetical protein  29.33 
 
 		 221 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1295  hypothetical protein  21.16 
 
 		 261 aa  44.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1160  hypothetical protein  21.16 
 
 		 261 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  35.8 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  23.33 
 
 		 248 aa  43.5  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  26.67 
 
 		 264 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  24.82 
 
 		 243 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4140  hypothetical protein  25.81 
 
 		 296 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950206  hitchhiker  0.001504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3871  hypothetical protein  29.77 
 
 		 203 aa  43.1  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  25.98 
 
 		 387 aa  42.7  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>