75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0552 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0552  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  100 
 
 		 285 aa  588  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.729182  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0662  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  52.67 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0653  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  53.87 
 
 		 285 aa  298  7e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00629996  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1472  hypothetical protein  47.06 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.427011  hitchhiker  0.0000874821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2006  8-oxoguanine DNA glycosylase  43.61 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000592743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1020  8-oxoguanine DNA glycosylase-like  35.71 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1131  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  34.94 
 
 		 279 aa  178  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000211663  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  35.97 
 
 		 297 aa  175  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3329  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  32.86 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00424191  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1540  HhH-GPD family protein  27.14 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000245501 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1385  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  33.33 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.391091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2068  8-oxoguanine DNA glycosylase-like protein  32.35 
 
 		 295 aa  158  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2279  8-oxoguanine DNA glycosylase, putative  30.82 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2577  putative 8-oxoguanine DNA glycosylase  30.49 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1980  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.96 
 
 		 334 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0823  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  34.68 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0815  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.97 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1065  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.91 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00474744  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35111  8-oxoguanine DNA glycosylase  27.63 
 
 		 336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  27.66 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1517  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  31.51 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0048672 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.05 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.157692  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2444  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.72 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2407  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  30.5 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363205  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06682  mitochondrial glycosylase/lyase (Eurofung)  27.44 
 
 		 414 aa  112  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1405  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.52 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273157 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1208  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.91 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1164  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  28.38 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.561807 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1087  HhH-GPD  25.59 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.626477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1313  8-oxoguanine DNA glycosylase domain protein  26.19 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4304  predicted protein  29.58 
 
 		 245 aa  98.6  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1017  HhH-GPD  24.91 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0765881  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1267  HhH-GPD family protein  27.24 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318619  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02890  purine-specific oxidized base lesion DNA N-glycosylase, putative  23.51 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.259256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.49 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.7 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.7 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.7 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3487  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.44 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.604427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3499  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.44 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.596222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3774  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.59 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.727577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1457  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.65 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000180203 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.32 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3842  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.98 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3790  DNA-3-methyladenine glycosidase  27.65 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0522  HhH-GPD  24.39 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.589168  normal  0.454329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0783  HhH-GPD family protein  30.05 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1250  hypothetical protein  25.3 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.858422 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.29 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0738  HhH-GPD  30.05 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00497967  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  25.87 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3495  DNA-3-methyladenine glycosylase II  33.66 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482188 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.63 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  44.23 
 
 		 219 aa  46.2  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  47.62 
 
 		 278 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1125  HhH-GPD family protein  32.99 
 
 		 207 aa  45.8  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0775  HhH-GPD family protein  27.98 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  27.91 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0427  DNA-3-methyladenine glycosylase II  24.49 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  33.71 
 
 		 217 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2419  AlkA domain protein  26.59 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.839778  hitchhiker  0.00593166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2950  HhH-GPD family protein  25.84 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296829  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.65 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  27.81 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1733  HhH-GPD family protein  40.68 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.48 
 
 		 218 aa  43.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1219  transcriptional regulator, AraC family  24.55 
 
 		 492 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.627471  normal  0.0317838 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2423  transcriptional regulator, AraC family  23.96 
 
 		 496 aa  43.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245966 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2799  transcriptional regulator, Ada family/DNA-3-methyladenine glycosylase II  23.96 
 
 		 496 aa  43.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06530  3-methyladenine DNA glycosylase/8-oxoguanine DNA glycosylase  25.56 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.937537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3395  Ada metal-binding domain protein  23.28 
 
 		 526 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.438385  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0411  DNA-3-methyladenine glycosylase II  25.87 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  26.28 
 
 		 301 aa  42.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.81 
 
 		 240 aa  42.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3301  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  25.63 
 
 		 494 aa  42.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0977453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>