120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0306 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0306  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 114 aa  231  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.739579 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  64.86 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0163  carboxymuconolactone decarboxylase  71.84 
 
 		 116 aa  148  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0078  carboxymuconolactone decarboxylase  59.82 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0121  hypothetical protein  53.64 
 
 		 110 aa  135  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  35 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0332  carboxymuconolactone decarboxylase  34.12 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.711458  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0094  carboxymuconolactone decarboxylase  32.65 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0425129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0431  carboxymuconolactone decarboxylase  34.94 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0404  carboxymuconolactone decarboxylase  36.14 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0476  carboxymuconolactone decarboxylase  33.73 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.311058  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1515  carboxymuconolactone decarboxylase  33.73 
 
 		 104 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  25.23 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  31.25 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  28.16 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0673  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.03 
 
 		 128 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.73 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3671  carboxymuconolactone decarboxylase  29.13 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3703  carboxymuconolactone decarboxylase  38.03 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0681  carboxymuconolactone decarboxylase  38.03 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  32.94 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3552  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.72 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3257  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.146193  normal  0.0594926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  29.41 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.76 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.27 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0571  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  27.62 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3382  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.94 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  29.47 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0493  alkylhydroperoxidase  29.46 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.884775  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1046  alkylhydroperoxidase  33.66 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0332  alkylhydroperoxidase  32.67 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  29 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3646  carboxymuconolactone decarboxylase  35.21 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  29.91 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3748  alkylhydroperoxidase  30.21 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.72 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  29.9 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3862  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.07 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.23 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  24.47 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58220  hypothetical protein  29.81 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.876359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  30.49 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5100  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  29.55 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  34.25 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.16 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1580  alkylhydroperoxidase  32.67 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.589547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  27.52 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.35 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  36.07 
 
 		 392 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  25.3 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  21.59 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25.53 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.85 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25.53 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25.53 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25.53 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25.53 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.94 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1895  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.92 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00163146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1491  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.53 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1814  alkylhydroperoxidase AhpD domain protein  25.53 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  30.43 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  27.52 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 		 130 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 		 129 aa  42.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0934  carboxymuconolactone decarboxylase  31.94 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 		 130 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1313  carboxymuconolactone decarboxylase  30.23 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  31.94 
 
 		 396 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25.26 
 
 		 211 aa  42  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0248  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.66 
 
 		 150 aa  42  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.07 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  32.1 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2518  carboxymuconolactone decarboxylase  22.22 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.541729  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.07 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4188  carboxymuconolactone decarboxylase  35.21 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.412642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 		 132 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.41 
 
 		 109 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  25.26 
 
 		 203 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0939  carboxymuconolactone decarboxylase  31.75 
 
 		 126 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.947177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  27.52 
 
 		 113 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.56 
 
 		 123 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  25.56 
 
 		 123 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  27.37 
 
 		 147 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  25.33 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  29.41 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3252  carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.41 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  24.47 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>