226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6459 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  100 
 
 
299 aa  617  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  60.41 
 
 
305 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  61.3 
 
 
296 aa  359  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  59.04 
 
 
308 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  44.18 
 
 
275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  39.94 
 
 
321 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  39.79 
 
 
273 aa  178  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  38.06 
 
 
273 aa  176  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  38.75 
 
 
272 aa  176  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  39.73 
 
 
305 aa  175  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  40.21 
 
 
272 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  39.38 
 
 
272 aa  166  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  39.31 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  36.64 
 
 
273 aa  157  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  38.13 
 
 
297 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  39.66 
 
 
271 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  34.12 
 
 
282 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  37.07 
 
 
293 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  35.27 
 
 
272 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  36.64 
 
 
272 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.74 
 
 
272 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  36.3 
 
 
272 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  33.9 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  34.14 
 
 
293 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  36.39 
 
 
311 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  36.67 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  33.78 
 
 
306 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  36 
 
 
309 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  36 
 
 
309 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  36 
 
 
309 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  36 
 
 
309 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33.44 
 
 
306 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  36.43 
 
 
280 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  36 
 
 
309 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  35.22 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  35.22 
 
 
294 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  33 
 
 
293 aa  135  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  36.33 
 
 
309 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  34.92 
 
 
294 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  36.33 
 
 
309 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  34.92 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  36 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  34.78 
 
 
299 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  36 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  34.68 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  35.67 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  34.9 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  34.01 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  33.22 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  34.98 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  35 
 
 
309 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  35 
 
 
309 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  35 
 
 
312 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  35 
 
 
309 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  32.69 
 
 
310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  34.67 
 
 
309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  34.67 
 
 
309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  35.35 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  34.67 
 
 
309 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  34.67 
 
 
309 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  31.88 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  32.21 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  35.23 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4165  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  34.67 
 
 
297 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.33 
 
 
294 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  35.25 
 
 
311 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  33.45 
 
 
453 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  31.1 
 
 
301 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  33 
 
 
297 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  32.69 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  30.03 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  31.67 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  31.68 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  30.16 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  32.57 
 
 
326 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  32.44 
 
 
295 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  33.56 
 
 
294 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  30.56 
 
 
287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  29.51 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  33.22 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  35.57 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  31.42 
 
 
290 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  33.56 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0658  protein of unknown function DUF849  31.03 
 
 
276 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.53 
 
 
303 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  30.74 
 
 
300 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  33.78 
 
 
293 aa  116  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  30.74 
 
 
300 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  30.87 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  31.63 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  35.59 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0271  hypothetical protein  31.13 
 
 
310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0058593  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3495  hypothetical protein  31.42 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599737  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  31.96 
 
 
449 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3412  hypothetical protein  30.95 
 
 
277 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  33.22 
 
 
305 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2376  protein of unknown function DUF849  31.05 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  31.08 
 
 
280 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3475  protein of unknown function DUF849  31.08 
 
 
279 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>