52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6230 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  100 
 
 		 1248 aa  2501    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  50.58 
 
 		 1190 aa  947    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  47.78 
 
 		 1263 aa  848    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  47.92 
 
 		 1353 aa  921    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  48.53 
 
 		 1192 aa  860    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  84.51 
 
 		 1203 aa  1896    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  43.88 
 
 		 1160 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  32.44 
 
 		 1096 aa  313  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  29.98 
 
 		 1164 aa  303  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  28.13 
 
 		 1285 aa  253  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  34.79 
 
 		 1032 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1032 aa  122  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  33.69 
 
 		 1127 aa  113  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  40.54 
 
 		 783 aa  112  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5700  hypothetical protein  31.74 
 
 		 457 aa  106  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  28.54 
 
 		 1115 aa  101  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  33.74 
 
 		 669 aa  97.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  37.41 
 
 		 255 aa  96.3  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  38.93 
 
 		 671 aa  94  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  38.22 
 
 		 237 aa  92.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  52.81 
 
 		 915 aa  92.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  43.7 
 
 		 139 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  35.44 
 
 		 921 aa  84.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  35.88 
 
 		 871 aa  83.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  42.24 
 
 		 914 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1268 aa  77  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  45.37 
 
 		 701 aa  75.5  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  27.8 
 
 		 881 aa  73.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  33.13 
 
 		 794 aa  72  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  29.23 
 
 		 881 aa  71.6  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  27.98 
 
 		 859 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  27.98 
 
 		 859 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  42.06 
 
 		 968 aa  68.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  40.54 
 
 		 870 aa  67  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  39.86 
 
 		 881 aa  66.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  39.86 
 
 		 881 aa  66.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  29.59 
 
 		 1364 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  56.14 
 
 		 1120 aa  62.8  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  57.81 
 
 		 853 aa  62.4  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1231  hypothetical protein  49.28 
 
 		 647 aa  62.4  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  57.81 
 
 		 853 aa  62.4  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  57.81 
 
 		 853 aa  62.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  24.81 
 
 		 1063 aa  62  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  25.14 
 
 		 908 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  59.09 
 
 		 849 aa  60.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  32.65 
 
 		 1122 aa  59.3  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  41.27 
 
 		 1628 aa  52.4  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  53.45 
 
 		 1167 aa  51.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  33.04 
 
 		 274 aa  49.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  27.65 
 
 		 1222 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  31.39 
 
 		 781 aa  46.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  32.79 
 
 		 718 aa  45.8  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>