85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2754 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  46.95 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  46.95 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5261  putative transmembrane anti-sigma factor  47.53 
 
 		 268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  46.97 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  46.33 
 
 		 274 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  38.49 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  34.6 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  41.22 
 
 		 256 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  37.41 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  38.7 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  37.45 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  34.34 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  36.5 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  33.95 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.18 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  35.64 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  34.32 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2523  putative transmembrane anti-sigma factor  38.49 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.690899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3398  putative transmembrane anti-sigma factor  34.21 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.745464  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.84 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  32 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.21 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3377  putative transmembrane anti-sigma factor  35.16 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  33.81 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  34.26 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  34.16 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  35.04 
 
 		 255 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  35.04 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  30.26 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  33.86 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.98 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2555  putative transmembrane anti-sigma factor  34.66 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2783  putative transmembrane transcriptional regulator(anti-sigma factor) protein, PrtR  41.01 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1667  putative transmembrane anti-sigma factor  41.01 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1253  putative transmembrane anti-sigma factor  34.66 
 
 		 279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0479785  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3001  putative transmembrane anti-sigma factor  44.19 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2982  hypothetical protein  32.28 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3944  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  32.7 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00740335  normal  0.0369582 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1501  hypothetical protein  33.71 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204589  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1186  hypothetical protein  33.07 
 
 		 274 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  30.35 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  32.1 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000249253 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0015  hypothetical protein  33.21 
 
 		 495 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1155  hypothetical protein  32.95 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0424  hypothetical protein  32.95 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0145  hypothetical protein  32.95 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1414  hypothetical protein  32.95 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142705  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  31.2 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0855  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366382  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3785  putative transmembrane anti-sigma factor  33.45 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1386  hypothetical protein  32.7 
 
 		 270 aa  95.9  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0048642  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0728  putative transmembrane anti-sigma factor  30.71 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  29.12 
 
 		 252 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  31.3 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  30.89 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  30.89 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2533  putative transmembrane anti-sigma factor  37.4 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420248  normal  0.0303873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2801  putative transmembrane anti-sigma factor  32.31 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.261643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  32.55 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  29.57 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00133889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0009  putative transmembrane anti-sigma factor  30.13 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  29.3 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0070  transmembrane regulator PrtR  30.71 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0373  putative transmembrane anti-sigma factor  35 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2893  putative transmembrane anti-sigma factor  33.2 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0083  transmembrane regulator PrtR  30.17 
 
 		 252 aa  72  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6219  transcriptional regulator  27.56 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0474635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0083  transmembrane regulator PrtR  30.17 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0293  transmembrane regulator PrtR  30.17 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000206398  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  26.12 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6012  putative transmembrane anti-sigma factor  24.33 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.784619  normal  0.0731526 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7160  putative transmembrane anti-sigma factor  22.99 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494902  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4456  putative transmembrane anti-sigma factor  24.03 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1105  putative transmembrane anti-sigma factor  22.84 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2675  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  24.62 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  29.44 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0338  putative transmembrane anti-sigma factor  26.89 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.181007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4006  putative transmembrane anti-sigma factor  27.49 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4787  putative transmembrane anti-sigma factor  27.14 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1422  putative transmembrane anti-sigma factor  28.3 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000152336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  41.18 
 
 		 245 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02866  transmembrane regulator protein PrtR  26.87 
 
 		 167 aa  42.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.822943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>