36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1105 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1105  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 283 aa  564  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1005  putative transmembrane anti-sigma factor  50.88 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  26.76 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  26.64 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  22.57 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  42.65 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  46.15 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  50.79 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  24.56 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  23.18 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  23.18 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  43.75 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  40.3 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  23.88 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  39.06 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  25.61 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  26.09 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  40 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  24.13 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4551  putative transmembrane anti-sigma factor  29.26 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  39.68 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3377  putative transmembrane anti-sigma factor  37.68 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  40 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  28.52 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  39.74 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  41.27 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3944  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  25.27 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00740335  normal  0.0369582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  26.54 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  24.54 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  39.39 
 
 		 274 aa  42.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0083  transmembrane regulator PrtR  39.66 
 
 		 252 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  39.68 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  41.27 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2555  putative transmembrane anti-sigma factor  30.84 
 
 		 279 aa  42.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  39.62 
 
 		 253 aa  42  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0083  transmembrane regulator PrtR  39.66 
 
 		 252 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>