16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0017 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 245 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4981  putative transmembrane anti-sigma factor  45.97 
 
 		 240 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0714107 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1670  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  45.56 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.2145 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  25.87 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  25.82 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  35.82 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  25.66 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  25.66 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  25.66 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  30.63 
 
 		 259 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  38.71 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1005  putative transmembrane anti-sigma factor  38 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368006 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  25.66 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4551  putative transmembrane anti-sigma factor  30.84 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  29.31 
 
 		 277 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  31.88 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>