92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1653 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  100 
 
 		 253 aa  502  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  45.42 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  42.53 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  43.43 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  43.37 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  42.42 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  37.31 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  41.67 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  42.4 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  41.11 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  39.7 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  42.28 
 
 		 264 aa  158  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2555  putative transmembrane anti-sigma factor  41.09 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  38.99 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  39.84 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  37.91 
 
 		 286 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  40.87 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  40.87 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  38.89 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3377  putative transmembrane anti-sigma factor  41.73 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  41.11 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  41.42 
 
 		 265 aa  148  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1253  putative transmembrane anti-sigma factor  39.38 
 
 		 279 aa  148  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0479785  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  36.92 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2523  putative transmembrane anti-sigma factor  39.62 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.690899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  41.5 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3785  putative transmembrane anti-sigma factor  43.38 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5261  putative transmembrane anti-sigma factor  38.04 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2783  putative transmembrane transcriptional regulator(anti-sigma factor) protein, PrtR  41.18 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.55 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3001  putative transmembrane anti-sigma factor  51.91 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  35.5 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1667  putative transmembrane anti-sigma factor  38.82 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3398  putative transmembrane anti-sigma factor  34.48 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.745464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0855  putative transmembrane anti-sigma factor  39.51 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366382  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2982  hypothetical protein  36.43 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3944  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.88 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00740335  normal  0.0369582 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  38.68 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1501  hypothetical protein  43.84 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204589  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  37.2 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1386  hypothetical protein  39.76 
 
 		 270 aa  111  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0048642  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  39 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000249253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2533  putative transmembrane anti-sigma factor  36.74 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420248  normal  0.0303873 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0015  hypothetical protein  42.86 
 
 		 495 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1414  hypothetical protein  42.86 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142705  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0728  putative transmembrane anti-sigma factor  39.08 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  35.04 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  34.62 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0145  hypothetical protein  41.35 
 
 		 274 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0424  hypothetical protein  41.35 
 
 		 274 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1155  hypothetical protein  41.35 
 
 		 274 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1186  hypothetical protein  41.35 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  34.19 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  32.17 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0070  transmembrane regulator PrtR  35 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3067  putative transmembrane anti-sigma factor  27.74 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0599961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  32.17 
 
 		 250 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0373  putative transmembrane anti-sigma factor  45 
 
 		 126 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2801  putative transmembrane anti-sigma factor  33.77 
 
 		 250 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.261643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  34.31 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0083  transmembrane regulator PrtR  35.5 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0293  transmembrane regulator PrtR  37.25 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000206398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0083  transmembrane regulator PrtR  36.76 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  29.83 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.66 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0009  putative transmembrane anti-sigma factor  34.31 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2803  putative transmembrane anti-sigma factor  24.63 
 
 		 280 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0342001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  34.31 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00133889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  33.82 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4456  putative transmembrane anti-sigma factor  27.92 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1105  putative transmembrane anti-sigma factor  41.56 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6012  putative transmembrane anti-sigma factor  28.63 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.784619  normal  0.0731526 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7160  putative transmembrane anti-sigma factor  27.84 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494902  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0433  putative transmembrane anti-sigma factor  26.59 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  30.62 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  27.16 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2893  putative transmembrane anti-sigma factor  62.16 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0401  putative transmembrane anti-sigma factor  24.34 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.489246 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6219  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0474635  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02209  putative transmembrane protein  34.01 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.991816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4551  putative transmembrane anti-sigma factor  35.71 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1369  putative transmembrane anti-sigma factor  45.83 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1375  hypothetical protein  44.44 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1649  putative transmembrane anti-sigma factor  44.44 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0261743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1005  putative transmembrane anti-sigma factor  36.76 
 
 		 307 aa  45.4  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2886  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  23.5 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.887162  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02866  transmembrane regulator protein PrtR  30.77 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.822943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00667  hypothetical protein  35.96 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>