82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0826 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 259 aa  507  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0855  putative transmembrane anti-sigma factor  98.07 
 
 		 260 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366382  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3944  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  87.64 
 
 		 260 aa  430  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00740335  normal  0.0369582 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  87.98 
 
 		 259 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0728  putative transmembrane anti-sigma factor  88.37 
 
 		 261 aa  407  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2533  putative transmembrane anti-sigma factor  80.69 
 
 		 260 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420248  normal  0.0303873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0373  putative transmembrane anti-sigma factor  97.62 
 
 		 126 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  46.37 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1501  hypothetical protein  45.62 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  48.54 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000249253 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1386  hypothetical protein  45.15 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0048642  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1186  hypothetical protein  43.88 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1414  hypothetical protein  44.24 
 
 		 274 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142705  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0015  hypothetical protein  44.24 
 
 		 495 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2783  putative transmembrane transcriptional regulator(anti-sigma factor) protein, PrtR  43.4 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0145  hypothetical protein  43.53 
 
 		 274 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0424  hypothetical protein  43.53 
 
 		 274 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1155  hypothetical protein  43.53 
 
 		 274 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1667  putative transmembrane anti-sigma factor  42.96 
 
 		 283 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  36.26 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  36.99 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3377  putative transmembrane anti-sigma factor  38.81 
 
 		 294 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  36.86 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3001  putative transmembrane anti-sigma factor  37.45 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2555  putative transmembrane anti-sigma factor  35.69 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  36.12 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1253  putative transmembrane anti-sigma factor  35.69 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0479785  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  37.98 
 
 		 259 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  36.89 
 
 		 264 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  34.27 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  34.27 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  34.12 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.05 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  37.55 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  29.58 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.01 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  30.86 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  30.66 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3398  putative transmembrane anti-sigma factor  31.85 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.745464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  33.98 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  31.54 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  36.72 
 
 		 266 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  35.14 
 
 		 277 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  32.5 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2523  putative transmembrane anti-sigma factor  30.23 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.690899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5261  putative transmembrane anti-sigma factor  33.2 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  31.85 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  35.56 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  35.15 
 
 		 255 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3785  putative transmembrane anti-sigma factor  36.94 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  42.54 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2982  hypothetical protein  30.89 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0070  transmembrane regulator PrtR  32.92 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  30.27 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  29.21 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  34.26 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3067  putative transmembrane anti-sigma factor  27.54 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0599961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2803  putative transmembrane anti-sigma factor  25.82 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0342001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  29.44 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  29.51 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  28.16 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  28.16 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0293  transmembrane regulator PrtR  32.6 
 
 		 252 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000206398  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  27.43 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0083  transmembrane regulator PrtR  32.6 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  27.76 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0083  transmembrane regulator PrtR  32.16 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0009  putative transmembrane anti-sigma factor  26.22 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  31.78 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  30.53 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  26.22 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00133889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2801  putative transmembrane anti-sigma factor  31.78 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.261643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2893  putative transmembrane anti-sigma factor  30.84 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  30.84 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  27.48 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  30.1 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0401  putative transmembrane anti-sigma factor  23.53 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.489246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  27.35 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0433  putative transmembrane anti-sigma factor  27.71 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1105  putative transmembrane anti-sigma factor  26.37 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0389  putative transmembrane anti-sigma factor  25.79 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4551  putative transmembrane anti-sigma factor  26.19 
 
 		 257 aa  42  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>