38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02866 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02866  transmembrane regulator protein PrtR  100 
 
 		 167 aa  333  9e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.822943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  38.41 
 
 		 250 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2893  putative transmembrane anti-sigma factor  38.41 
 
 		 250 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2801  putative transmembrane anti-sigma factor  37.75 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.261643 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  39.07 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  35.47 
 
 		 253 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00133889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  35.76 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0009  putative transmembrane anti-sigma factor  34.88 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.3 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  34.12 
 
 		 252 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  34.12 
 
 		 252 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  34.12 
 
 		 252 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  33.93 
 
 		 253 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0083  transmembrane regulator PrtR  34.55 
 
 		 252 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0070  transmembrane regulator PrtR  33.73 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0083  transmembrane regulator PrtR  34.13 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0293  transmembrane regulator PrtR  34.13 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000206398  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5261  putative transmembrane anti-sigma factor  32.85 
 
 		 268 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  32.31 
 
 		 256 aa  51.2  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  31.3 
 
 		 257 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  27.78 
 
 		 277 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  32.28 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  27.44 
 
 		 275 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  28.42 
 
 		 286 aa  44.3  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  28.79 
 
 		 259 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  29.57 
 
 		 255 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  29.17 
 
 		 277 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  28.42 
 
 		 286 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  30.77 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  29.57 
 
 		 255 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  26.87 
 
 		 268 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  33.66 
 
 		 264 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  25.56 
 
 		 265 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  37.33 
 
 		 266 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  31.88 
 
 		 266 aa  41.2  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  31.88 
 
 		 266 aa  41.2  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1386  hypothetical protein  34 
 
 		 270 aa  40.8  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0048642  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2783  putative transmembrane transcriptional regulator(anti-sigma factor) protein, PrtR  33.33 
 
 		 283 aa  40.8  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>