35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6012 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_6012  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 255 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.784619  normal  0.0731526 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7160  putative transmembrane anti-sigma factor  94.12 
 
 		 255 aa  487  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494902  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6219  transcriptional regulator  49.81 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0474635  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3672  hypothetical protein  45.85 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.671386 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3094  putative transmembrane anti-sigma factor  46.88 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.334579  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3821  putative transmembrane anti-sigma factor  46.88 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  41.83 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4551  putative transmembrane anti-sigma factor  40.16 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3927  putative transmembrane anti-sigma factor  36.8 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1369  putative transmembrane anti-sigma factor  38.14 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1375  hypothetical protein  37.29 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1649  putative transmembrane anti-sigma factor  37.29 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0261743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3973  putative transmembrane anti-sigma factor  35.86 
 
 		 251 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal  0.293955 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  28.57 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  30.81 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  26.85 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  26.85 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  24.33 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  27.63 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  26.82 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  28.4 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  26.77 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5261  putative transmembrane anti-sigma factor  26.05 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  26.75 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  29.05 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  29.05 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  29.05 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  28.44 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  28.57 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  26.07 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  40.74 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  26.69 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  23.81 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  38.33 
 
 		 274 aa  42  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  26.57 
 
 		 271 aa  42  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>