87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2466 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  511  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  68.09 
 
 		 259 aa  337  8e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  67.97 
 
 		 256 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  45.98 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  38.82 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  38.82 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  38.55 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  38.7 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  42.91 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5261  putative transmembrane anti-sigma factor  40.54 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  39.78 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.06 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  36.19 
 
 		 286 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  37.4 
 
 		 264 aa  151  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  36.03 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  36.59 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  35.4 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  34.56 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  34.33 
 
 		 272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  33.46 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  32.73 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  40.93 
 
 		 274 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  31.84 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  35.71 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2523  putative transmembrane anti-sigma factor  34.94 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.690899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  35.9 
 
 		 257 aa  121  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  35.47 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  35.47 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2982  hypothetical protein  35.29 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  34.73 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  35.04 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2555  putative transmembrane anti-sigma factor  31.48 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3377  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 294 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  35.17 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000249253 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  34.52 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3944  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  36.61 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00740335  normal  0.0369582 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2533  putative transmembrane anti-sigma factor  35.17 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420248  normal  0.0303873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0855  putative transmembrane anti-sigma factor  34.51 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366382  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1253  putative transmembrane anti-sigma factor  30.86 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0479785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  33.61 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3398  putative transmembrane anti-sigma factor  31.52 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.745464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3785  putative transmembrane anti-sigma factor  35.82 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.56 
 
 		 271 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3001  putative transmembrane anti-sigma factor  32.45 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1667  putative transmembrane anti-sigma factor  34.72 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0070  transmembrane regulator PrtR  34.15 
 
 		 250 aa  105  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2783  putative transmembrane transcriptional regulator(anti-sigma factor) protein, PrtR  34.36 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0083  transmembrane regulator PrtR  36.84 
 
 		 252 aa  98.6  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0728  putative transmembrane anti-sigma factor  34.39 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0293  transmembrane regulator PrtR  36.44 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000206398  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.34 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0083  transmembrane regulator PrtR  36.44 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1386  hypothetical protein  33.2 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0048642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1501  hypothetical protein  32.67 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204589  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  35.05 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00133889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0009  putative transmembrane anti-sigma factor  34.2 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1186  hypothetical protein  34.27 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1414  hypothetical protein  37.7 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  35.82 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  32.32 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  32.32 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1155  hypothetical protein  37.7 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0015  hypothetical protein  37.7 
 
 		 495 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0424  hypothetical protein  37.7 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0145  hypothetical protein  37.7 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2801  putative transmembrane anti-sigma factor  33.84 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.261643 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0373  putative transmembrane anti-sigma factor  40 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2893  putative transmembrane anti-sigma factor  33.84 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3067  putative transmembrane anti-sigma factor  24.91 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0599961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  25.79 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6219  transcriptional regulator  28.11 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0474635  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2803  putative transmembrane anti-sigma factor  24.44 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0342001 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1005  putative transmembrane anti-sigma factor  46.77 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1105  putative transmembrane anti-sigma factor  43.75 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7160  putative transmembrane anti-sigma factor  26.69 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494902  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4551  putative transmembrane anti-sigma factor  27.38 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6012  putative transmembrane anti-sigma factor  27.49 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.784619  normal  0.0731526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2976  hypothetical protein  26.84 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  38.68 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3973  putative transmembrane anti-sigma factor  25.64 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal  0.293955 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3927  putative transmembrane anti-sigma factor  28.85 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1375  hypothetical protein  49.21 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1369  putative transmembrane anti-sigma factor  47.22 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1649  putative transmembrane anti-sigma factor  49.21 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0261743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>