39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4551 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4551  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 257 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  87.6 
 
 		 259 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1375  hypothetical protein  53.04 
 
 		 266 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1649  putative transmembrane anti-sigma factor  53.25 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0261743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1369  putative transmembrane anti-sigma factor  52.82 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3927  putative transmembrane anti-sigma factor  50.59 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7160  putative transmembrane anti-sigma factor  40.55 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494902  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6012  putative transmembrane anti-sigma factor  40.16 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.784619  normal  0.0731526 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6219  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0474635  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3672  hypothetical protein  39.76 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.671386 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3821  putative transmembrane anti-sigma factor  36.96 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3094  putative transmembrane anti-sigma factor  36.96 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.334579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3973  putative transmembrane anti-sigma factor  33.87 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal  0.293955 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  39.42 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  36.59 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  36.59 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  41.82 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  34.29 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  34.29 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  52.83 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  45.71 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  29.04 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.93 
 
 		 271 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  28.9 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.7 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  33.71 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  38.55 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  40.85 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  37.35 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  52.94 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  57.5 
 
 		 253 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  41.43 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  46.03 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  23.83 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  39.13 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  39.09 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  56.1 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1105  putative transmembrane anti-sigma factor  29.26 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  37.18 
 
 		 250 aa  42  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>