74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0373 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0855  putative transmembrane anti-sigma factor  99.21 
 
 		 260 aa  247  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366382  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0373  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 126 aa  245  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  97.62 
 
 		 259 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  92.06 
 
 		 259 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0728  putative transmembrane anti-sigma factor  92.06 
 
 		 261 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3944  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  88.1 
 
 		 260 aa  224  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00740335  normal  0.0369582 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2533  putative transmembrane anti-sigma factor  82.54 
 
 		 260 aa  204  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420248  normal  0.0303873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1667  putative transmembrane anti-sigma factor  50.4 
 
 		 283 aa  130  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2783  putative transmembrane transcriptional regulator(anti-sigma factor) protein, PrtR  50.4 
 
 		 283 aa  130  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  51.2 
 
 		 264 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1386  hypothetical protein  50.4 
 
 		 270 aa  120  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0048642  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0015  hypothetical protein  53.98 
 
 		 495 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1501  hypothetical protein  53.98 
 
 		 274 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204589  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1414  hypothetical protein  53.98 
 
 		 274 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142705  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1186  hypothetical protein  53.1 
 
 		 274 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1155  hypothetical protein  53.1 
 
 		 274 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0424  hypothetical protein  53.1 
 
 		 274 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0145  hypothetical protein  53.1 
 
 		 274 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  48.31 
 
 		 253 aa  103  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000249253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  47.27 
 
 		 256 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  45.3 
 
 		 272 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3001  putative transmembrane anti-sigma factor  46.09 
 
 		 279 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  45 
 
 		 253 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  48.21 
 
 		 259 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3377  putative transmembrane anti-sigma factor  50 
 
 		 294 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2555  putative transmembrane anti-sigma factor  42.74 
 
 		 279 aa  88.6  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  37.82 
 
 		 271 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  42.86 
 
 		 264 aa  87  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1253  putative transmembrane anti-sigma factor  42.74 
 
 		 279 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0479785  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  42.02 
 
 		 256 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  38.66 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  38.66 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  43.75 
 
 		 266 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5261  putative transmembrane anti-sigma factor  42.34 
 
 		 268 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  39.67 
 
 		 277 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  35 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  36.89 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3398  putative transmembrane anti-sigma factor  37.93 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.745464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  34.43 
 
 		 277 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  36.21 
 
 		 260 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.5 
 
 		 275 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  36.75 
 
 		 275 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2523  putative transmembrane anti-sigma factor  35.34 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.690899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  34.78 
 
 		 269 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  34.23 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3785  putative transmembrane anti-sigma factor  36.76 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.33 
 
 		 271 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  39.47 
 
 		 255 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  39.47 
 
 		 255 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  39.47 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  39.02 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3067  putative transmembrane anti-sigma factor  29.03 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0599961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0070  transmembrane regulator PrtR  37.14 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2803  putative transmembrane anti-sigma factor  29.03 
 
 		 280 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0342001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  30.84 
 
 		 250 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2982  hypothetical protein  31.9 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2801  putative transmembrane anti-sigma factor  30.84 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.261643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  29.13 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2893  putative transmembrane anti-sigma factor  29.91 
 
 		 250 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  29.91 
 
 		 250 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  29.13 
 
 		 286 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  35.16 
 
 		 250 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  30.58 
 
 		 275 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0293  transmembrane regulator PrtR  34.62 
 
 		 252 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000206398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0083  transmembrane regulator PrtR  34.62 
 
 		 252 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0083  transmembrane regulator PrtR  33.33 
 
 		 252 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34 
 
 		 252 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  32.14 
 
 		 253 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  31.52 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0009  putative transmembrane anti-sigma factor  30.43 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  31.52 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  30.43 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00133889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  30.43 
 
 		 252 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>