80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0293 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0293  transmembrane regulator PrtR  100 
 
 		 252 aa  487  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000206398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0083  transmembrane regulator PrtR  98.41 
 
 		 252 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0083  transmembrane regulator PrtR  98.81 
 
 		 252 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0070  transmembrane regulator PrtR  90.76 
 
 		 250 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  66.93 
 
 		 252 aa  328  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  66.14 
 
 		 252 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  66.14 
 
 		 252 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  66.14 
 
 		 252 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  66.53 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00133889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0009  putative transmembrane anti-sigma factor  65.32 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  64.8 
 
 		 253 aa  288  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  48.32 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2801  putative transmembrane anti-sigma factor  39.27 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.261643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  38.87 
 
 		 250 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  38.06 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2893  putative transmembrane anti-sigma factor  39.92 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  34.16 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5261  putative transmembrane anti-sigma factor  36.51 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  33.86 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  34.58 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  35.63 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  33.47 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  33.47 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  34.24 
 
 		 277 aa  95.9  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  35.18 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  35.18 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  32.81 
 
 		 271 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  30.58 
 
 		 268 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.5 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.87 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  39.33 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  34.92 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  36 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  36.11 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2982  hypothetical protein  35 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3377  putative transmembrane anti-sigma factor  31.87 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  28.57 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  32.5 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  28.85 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  28.09 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  33.06 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  30.12 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0855  putative transmembrane anti-sigma factor  34.63 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366382  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  30.28 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  35 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  31.12 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  27.27 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3944  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.74 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00740335  normal  0.0369582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  30.29 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  33.77 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  33.91 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0728  putative transmembrane anti-sigma factor  33.04 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  29 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000249253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3785  putative transmembrane anti-sigma factor  34.17 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3001  putative transmembrane anti-sigma factor  31.43 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02866  transmembrane regulator protein PrtR  33.33 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.822943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2523  putative transmembrane anti-sigma factor  28.81 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.690899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2555  putative transmembrane anti-sigma factor  29.63 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1253  putative transmembrane anti-sigma factor  29.75 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0479785  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1667  putative transmembrane anti-sigma factor  32.76 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3398  putative transmembrane anti-sigma factor  28.1 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.745464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2533  putative transmembrane anti-sigma factor  32.38 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420248  normal  0.0303873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2783  putative transmembrane transcriptional regulator(anti-sigma factor) protein, PrtR  33.68 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1005  putative transmembrane anti-sigma factor  44.78 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368006 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0373  putative transmembrane anti-sigma factor  34.29 
 
 		 126 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6012  putative transmembrane anti-sigma factor  29.7 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.784619  normal  0.0731526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3067  putative transmembrane anti-sigma factor  25.97 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0599961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1501  hypothetical protein  33.88 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204589  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1386  hypothetical protein  36.84 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0048642  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142705  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0015  hypothetical protein  33.33 
 
 		 495 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0424  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1155  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2803  putative transmembrane anti-sigma factor  26.6 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0342001 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7160  putative transmembrane anti-sigma factor  27.23 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494902  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1105  putative transmembrane anti-sigma factor  25.74 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  25.94 
 
 		 275 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3927  putative transmembrane anti-sigma factor  35.97 
 
 		 255 aa  42  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>