40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1005 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1005  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 307 aa  588  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1105  putative transmembrane anti-sigma factor  28.76 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  43.04 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  44.93 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  43.48 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0083  transmembrane regulator PrtR  46.27 
 
 		 252 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  43.48 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  43.48 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  41.77 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0293  transmembrane regulator PrtR  44.78 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000206398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0083  transmembrane regulator PrtR  44.78 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  42.86 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  40.58 
 
 		 259 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  50.88 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0070  transmembrane regulator PrtR  50.94 
 
 		 250 aa  52.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  44.78 
 
 		 271 aa  52.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  42.86 
 
 		 253 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00133889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0009  putative transmembrane anti-sigma factor  42.86 
 
 		 253 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  39.44 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  45.61 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  43.42 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  47.83 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  47.37 
 
 		 255 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0433  putative transmembrane anti-sigma factor  26.58 
 
 		 267 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  40 
 
 		 277 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  40.32 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  47.37 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  40.32 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  24 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  38.6 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  37.5 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  37.5 
 
 		 245 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  37.93 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  34.07 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0401  putative transmembrane anti-sigma factor  38.6 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.489246 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1501  hypothetical protein  28.94 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  44 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1369  putative transmembrane anti-sigma factor  39.19 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  42.65 
 
 		 264 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  33.7 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>