39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4483 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 259 aa  510  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4551  putative transmembrane anti-sigma factor  87.6 
 
 		 257 aa  443  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1375  hypothetical protein  53.23 
 
 		 266 aa  228  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1649  putative transmembrane anti-sigma factor  53.23 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0261743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1369  putative transmembrane anti-sigma factor  52.82 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3927  putative transmembrane anti-sigma factor  49.61 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7160  putative transmembrane anti-sigma factor  41.49 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494902  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6012  putative transmembrane anti-sigma factor  41.83 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.784619  normal  0.0731526 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6219  transcriptional regulator  38.4 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0474635  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3672  hypothetical protein  40.48 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.671386 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3821  putative transmembrane anti-sigma factor  37.98 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3094  putative transmembrane anti-sigma factor  37.98 
 
 		 255 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.334579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3973  putative transmembrane anti-sigma factor  31.3 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal  0.293955 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.23 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  30.86 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  40.38 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  29.86 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  26.84 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  25.29 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.93 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  25.29 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  40.23 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.02 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  42.86 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  39.08 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  40.85 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0855  putative transmembrane anti-sigma factor  26.94 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366382  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  42.86 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  57.14 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  27.65 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  40.58 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  49.02 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  38.18 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  42.11 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  39.25 
 
 		 286 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  41.43 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>