27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3672 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3672  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  487  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.671386 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3094  putative transmembrane anti-sigma factor  89.8 
 
 		 255 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.334579  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3821  putative transmembrane anti-sigma factor  89.41 
 
 		 255 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563425 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7160  putative transmembrane anti-sigma factor  46.48 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494902  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6012  putative transmembrane anti-sigma factor  46.67 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.784619  normal  0.0731526 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6219  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0474635  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  41.18 
 
 		 259 aa  148  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1369  putative transmembrane anti-sigma factor  43.7 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4551  putative transmembrane anti-sigma factor  40.23 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1649  putative transmembrane anti-sigma factor  42.02 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0261743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1375  hypothetical protein  45.77 
 
 		 266 aa  135  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3927  putative transmembrane anti-sigma factor  39.92 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3973  putative transmembrane anti-sigma factor  39 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal  0.293955 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  53.23 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  46.67 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  36.44 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  36.44 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  35.51 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  28.79 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  28.74 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  28.74 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  28.74 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  41.94 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  45.16 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  43.33 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  60.98 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  29.73 
 
 		 252 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>