47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3927 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3927  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 255 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  49.61 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4551  putative transmembrane anti-sigma factor  50.59 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1649  putative transmembrane anti-sigma factor  52.89 
 
 		 256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0261743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1375  hypothetical protein  52.48 
 
 		 266 aa  218  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1369  putative transmembrane anti-sigma factor  52.48 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7160  putative transmembrane anti-sigma factor  36.8 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494902  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6219  transcriptional regulator  37.13 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0474635  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6012  putative transmembrane anti-sigma factor  36.8 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.784619  normal  0.0731526 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3672  hypothetical protein  39.92 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.671386 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3821  putative transmembrane anti-sigma factor  40.47 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3094  putative transmembrane anti-sigma factor  40.47 
 
 		 255 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.334579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3973  putative transmembrane anti-sigma factor  29.96 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal  0.293955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  39.42 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  38.82 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1005  putative transmembrane anti-sigma factor  43.28 
 
 		 307 aa  52.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368006 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  35.58 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  31.15 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  31.15 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  41.79 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  29.17 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  28.83 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  55.1 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  28 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  29.45 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  45.61 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0083  transmembrane regulator PrtR  35.04 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  51.02 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  28.57 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  37.76 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0083  transmembrane regulator PrtR  34.31 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0293  transmembrane regulator PrtR  34.31 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000206398  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  26.59 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2801  putative transmembrane anti-sigma factor  48.98 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.261643 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  36.73 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  32.77 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  36.73 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  43.08 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  42.59 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  25.71 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5261  putative transmembrane anti-sigma factor  46.94 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  42.86 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  39.74 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  42.86 
 
 		 277 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  36.21 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  42.37 
 
 		 253 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00133889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0009  putative transmembrane anti-sigma factor  42.37 
 
 		 253 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>