More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4452 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
205 aa  410  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  37.19 
 
 
211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.89 
 
 
211 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 
213 aa  134  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  35.12 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  37.2 
 
 
211 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 
211 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  37.88 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  37.2 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  35.48 
 
 
222 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 
213 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  35.48 
 
 
222 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  35.48 
 
 
222 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.07 
 
 
207 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 
203 aa  128  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  36.23 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  36.23 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  35.89 
 
 
212 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 
213 aa  124  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  39.02 
 
 
211 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  34.74 
 
 
218 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  36.41 
 
 
213 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 
213 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  37.25 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  38.14 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.25 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  37.25 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  36.89 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  37.63 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  36.76 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  37.44 
 
 
207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.05 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 
208 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 
212 aa  111  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  35.11 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.11 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.2 
 
 
206 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.54 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.38 
 
 
201 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  34.15 
 
 
211 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 
207 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0679  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.22 
 
 
207 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  31.22 
 
 
208 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  34.55 
 
 
207 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  30.24 
 
 
208 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.28 
 
 
222 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  31.1 
 
 
209 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  30.24 
 
 
208 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 
209 aa  101  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  33.98 
 
 
208 aa  101  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  30.24 
 
 
208 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
210 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
205 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.19 
 
 
213 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.02 
 
 
212 aa  98.2  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.1 
 
 
213 aa  97.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  34.09 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1489  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.6 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  26.9 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.93 
 
 
207 aa  95.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000642  transporter LysE family  29.1 
 
 
204 aa  94.7  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 
213 aa  94.7  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.376522  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  27.59 
 
 
210 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 
203 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  30 
 
 
203 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  26.57 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3025  amino acid transporter LysE  32.98 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0495687 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  27.59 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  27.59 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  28.08 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  27.59 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  27.59 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  27.59 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  27.54 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  32.5 
 
 
203 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7111  RhtB family transporter  28.57 
 
 
215 aa  91.7  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1221  transporter, LysE family  31.87 
 
 
209 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 
208 aa  91.7  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  33.54 
 
 
209 aa  91.3  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.85 
 
 
205 aa  91.7  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  29.76 
 
 
208 aa  91.3  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  29.76 
 
 
208 aa  91.3  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.65 
 
 
211 aa  91.3  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  28.08 
 
 
210 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  32.49 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2130  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.69 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  29.44 
 
 
205 aa  89.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  28.44 
 
 
217 aa  89.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.56 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  26.44 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>