53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4370 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4370  Ion transport protein  100 
 
 		 277 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0586  Ion transport protein  58.36 
 
 		 295 aa  292  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2617  Ion transport protein  60.45 
 
 		 272 aa  289  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.017869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  48.08 
 
 		 261 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1761  cold shock protein  54.74 
 
 		 289 aa  277  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1920  Ion transport protein  49.66 
 
 		 290 aa  275  8e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  50 
 
 		 261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0087  Ion transport protein  46.9 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1575  Ion transport protein  52.65 
 
 		 268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2044  Ion transport protein  59.83 
 
 		 292 aa  272  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  46.51 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  49.24 
 
 		 288 aa  263  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  51.66 
 
 		 280 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4775  cation channel family protein  48.91 
 
 		 271 aa  256  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1706  Ion transport protein  51.3 
 
 		 280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  48.68 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  41.79 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  44.23 
 
 		 278 aa  234  8e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  49.8 
 
 		 278 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  46.91 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3404  ion transport protein  46.07 
 
 		 290 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  46.15 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  40.15 
 
 		 315 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2426  Ion transport protein  43.85 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2590  Ion transport protein  44.93 
 
 		 282 aa  191  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0425181  normal  0.02659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  40.82 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  33.7 
 
 		 415 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  29.74 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4165  Ion transport protein  29.74 
 
 		 276 aa  135  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3585  cation channel family protein  30.3 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  29.92 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  31.11 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3349  Ion transport protein  29.96 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00642666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  31.76 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43828  bacterial type voltage activated sodium channel  32.56 
 
 		 718 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3700  putative cation transporter component  27.24 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.772401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2669  Ion transport protein  32.12 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0277523 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1904  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  25.91 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  28.68 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4024  Ion transport protein  29.65 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.457934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43878  cation channel protein  34.85 
 
 		 469 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  26.79 
 
 		 1701 aa  89.4  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  30.37 
 
 		 938 aa  71.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16877  VIC family transporter: sodium/calcium ion channel  28.27 
 
 		 1012 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0101498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13647  VIC family transporter: calcium ion channel  22.1 
 
 		 1546 aa  53.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.998781  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01168  Calcium channel [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X1E9]  22.99 
 
 		 2110 aa  52  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03320  hypothetical protein  25.59 
 
 		 2028 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073092  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  23.43 
 
 		 1742 aa  49.7  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  25.26 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  21.52 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  30.51 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  23.38 
 
 		 533 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  21.43 
 
 		 419 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>