More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1243 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1243  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2674  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0812  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1713  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2190  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00893234  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2099  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 204 aa  174  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2390  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1681  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.665855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1940  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1751  riboflavin synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2577  riboflavin synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 218 aa  171  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02237  riboflavin synthase subunit alpha  45.85 
 
 		 203 aa  171  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2030  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 204 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1857  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462262  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01633  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1978  riboflavin synthase, alpha subunit  45.37 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000209039  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01623  hypothetical protein  45.37 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1748  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000886899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1742  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000343227  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1917  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0729931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2375  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1559  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.403477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1876  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224926  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1860  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000205404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1967  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.756733  hitchhiker  0.00000222488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1535  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0455024  hitchhiker  0.00124186 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1522  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1536  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1784  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 212 aa  168  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999549 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003523  lumazine protein  46.34 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.942929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1703  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.043412  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2145  riboflavin synthase subunit alpha  43.41 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110513  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1952  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000576135  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2040  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000661862  normal  0.015006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2036  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 203 aa  164  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357361  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2024  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 206 aa  164  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0115302  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2267  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 205 aa  164  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00496217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2181  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000128558  normal  0.0219696 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3729  riboflavin synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 237 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.794278  normal  0.402908 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2333  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0365218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4568  riboflavin synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 237 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3795  riboflavin synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 237 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2225  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00109556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2020  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.025182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2296  riboflavin synthase subunit alpha  43.41 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1383  riboflavin synthase subunit alpha  47.06 
 
 		 203 aa  160  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1865  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5522  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.189133  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3144  riboflavin synthase subunit alpha  42.99 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.212447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1762  riboflavin synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 202 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117708  normal  0.0239338 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2495  riboflavin synthase subunit alpha  43.27 
 
 		 204 aa  158  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634088  hitchhiker  0.00287874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2300  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 237 aa  158  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.745499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3686  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 237 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0704066  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2113  riboflavin synthase subunit alpha  44.23 
 
 		 235 aa  158  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4077  riboflavin synthase subunit alpha  44.23 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.578538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3429  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 238 aa  154  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2118  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.0673441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5723  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4434  riboflavin synthase subunit alpha  42.03 
 
 		 237 aa  147  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563917  normal  0.0752647 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0087  riboflavin synthase subunit alpha  38.61 
 
 		 207 aa  147  9e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0316788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4731  riboflavin synthase subunit alpha  41.55 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2867  riboflavin synthase subunit alpha  36.95 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.999273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2916  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8148  predicted protein  41.36 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.564807  normal  0.0620362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2115  riboflavin synthase subunit alpha  36.95 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.757101  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2775  riboflavin synthase subunit alpha  36.95 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  39.22 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  39.22 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  39.23 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  40.31 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0685  riboflavin synthase subunit alpha  37.07 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 204 aa  121  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  39.34 
 
 		 201 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  36.82 
 
 		 204 aa  121  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  38.95 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 200 aa  121  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  38.54 
 
 		 215 aa  121  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  37.23 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  37.23 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 217 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  37.23 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  40.96 
 
 		 217 aa  118  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  37.75 
 
 		 199 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 205 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  37.67 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  37.23 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  37.57 
 
 		 196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  35.96 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  35.64 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  38.71 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  35.64 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  40.31 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  35.58 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  38.3 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  35.79 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  35.45 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>