More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2424 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
342 aa  714    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  40.17 
 
 
341 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  41.62 
 
 
338 aa  285  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  38.87 
 
 
350 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  36.98 
 
 
353 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  37.54 
 
 
345 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  34.31 
 
 
331 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  34.56 
 
 
363 aa  215  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  34.55 
 
 
370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  34.51 
 
 
352 aa  212  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 
360 aa  210  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 
360 aa  210  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  35.16 
 
 
337 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  36.42 
 
 
357 aa  205  8e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  34.29 
 
 
359 aa  202  6e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  34.93 
 
 
326 aa  195  9e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  31.9 
 
 
366 aa  172  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  35.56 
 
 
357 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 
374 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  28.86 
 
 
356 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  31.31 
 
 
347 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 
359 aa  155  7e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  29.55 
 
 
383 aa  153  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  35.27 
 
 
356 aa  149  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  34.32 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 
358 aa  136  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 
335 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  31.21 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 
412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 
334 aa  132  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  31.52 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  35.04 
 
 
344 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
375 aa  125  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  30.74 
 
 
387 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  28.11 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 
353 aa  119  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 
377 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 
388 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 
353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  33.47 
 
 
350 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  35.12 
 
 
373 aa  116  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  33.47 
 
 
350 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  29.64 
 
 
349 aa  116  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.45 
 
 
369 aa  115  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1674  oxidoreductase domain protein  36.76 
 
 
311 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0873607  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 
349 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
350 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  31.97 
 
 
361 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 
321 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  32.2 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  33.05 
 
 
350 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 
353 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  29.41 
 
 
365 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  31.06 
 
 
347 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  32.05 
 
 
368 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
355 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  30.25 
 
 
345 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  27.2 
 
 
339 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 
347 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  29.55 
 
 
344 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 
340 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  27.93 
 
 
438 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  31.65 
 
 
352 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 
390 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 
344 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 
369 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 
333 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
355 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  33.99 
 
 
360 aa  102  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 
385 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_002950  PG2119  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.81 
 
 
323 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.858472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
359 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  32.76 
 
 
355 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  26.73 
 
 
360 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  32.33 
 
 
330 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  26.88 
 
 
339 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  24.91 
 
 
374 aa  100  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.26 
 
 
312 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  27.68 
 
 
341 aa  99.8  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 
388 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  37.91 
 
 
368 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  29.83 
 
 
357 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  30.93 
 
 
367 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 
344 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 
376 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  33.5 
 
 
353 aa  97.1  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  26.49 
 
 
346 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 
359 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 
359 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  23.77 
 
 
356 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 
405 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  28.83 
 
 
343 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  31.17 
 
 
345 aa  96.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>