More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1453 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  100 
 
 		 669 aa  1377    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  84.16 
 
 		 669 aa  1184    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  97.16 
 
 		 669 aa  1347    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  60.83 
 
 		 706 aa  863    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  96.41 
 
 		 669 aa  1339    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  26.11 
 
 		 647 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  24.21 
 
 		 661 aa  135  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.82 
 
 		 934 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  24.85 
 
 		 646 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  25.47 
 
 		 641 aa  128  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  25.41 
 
 		 643 aa  128  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  25.59 
 
 		 650 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  25.59 
 
 		 650 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.15 
 
 		 934 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.15 
 
 		 934 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.15 
 
 		 934 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.26 
 
 		 934 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.26 
 
 		 934 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  25.34 
 
 		 659 aa  125  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  22.81 
 
 		 673 aa  124  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.71 
 
 		 934 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  25.27 
 
 		 629 aa  120  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  24.06 
 
 		 574 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  24.3 
 
 		 668 aa  118  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  23.96 
 
 		 743 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  24.19 
 
 		 646 aa  117  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  25.3 
 
 		 929 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  23.53 
 
 		 725 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1828  helicase c2  23.45 
 
 		 688 aa  114  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147958  normal  0.434412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  23.2 
 
 		 725 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  24.16 
 
 		 707 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.62 
 
 		 929 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  23.33 
 
 		 713 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  25.11 
 
 		 651 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  24.17 
 
 		 674 aa  111  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1900  helicase c2  23.11 
 
 		 688 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  24.6 
 
 		 851 aa  109  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  25.34 
 
 		 832 aa  107  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  24.64 
 
 		 652 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  23.51 
 
 		 674 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  24.05 
 
 		 658 aa  103  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  22.97 
 
 		 636 aa  101  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.48 
 
 		 921 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  22.33 
 
 		 698 aa  100  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  23.39 
 
 		 641 aa  100  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  22.08 
 
 		 673 aa  99.8  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  24.39 
 
 		 646 aa  99.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.05 
 
 		 934 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.05 
 
 		 934 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  21.47 
 
 		 670 aa  94  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  22.74 
 
 		 755 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  22.12 
 
 		 751 aa  93.6  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  23.39 
 
 		 641 aa  92.8  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  22.99 
 
 		 757 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  23.68 
 
 		 699 aa  92.8  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  23.39 
 
 		 641 aa  92.8  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  21.46 
 
 		 672 aa  92.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.59 
 
 		 691 aa  92  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  23.79 
 
 		 790 aa  91.3  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  23.43 
 
 		 683 aa  91.3  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  22.27 
 
 		 785 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  31.2 
 
 		 641 aa  89  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  22.2 
 
 		 639 aa  89  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  34.47 
 
 		 649 aa  88.6  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  30.68 
 
 		 619 aa  87.4  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  31.92 
 
 		 647 aa  87.4  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.82 
 
 		 692 aa  87.4  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  30.74 
 
 		 645 aa  87  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.04 
 
 		 692 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.34 
 
 		 934 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  22.35 
 
 		 664 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.77 
 
 		 690 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  31.8 
 
 		 651 aa  84.7  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.4 
 
 		 690 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  23.07 
 
 		 986 aa  84.3  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.9 
 
 		 944 aa  84  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.21 
 
 		 690 aa  84  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  31.92 
 
 		 665 aa  84  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.21 
 
 		 690 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.21 
 
 		 690 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.4 
 
 		 690 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.12 
 
 		 691 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.4 
 
 		 690 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  23.99 
 
 		 781 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.4 
 
 		 690 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.4 
 
 		 690 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.4 
 
 		 690 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.41 
 
 		 956 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  31.4 
 
 		 653 aa  82  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.91 
 
 		 690 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  30.51 
 
 		 729 aa  81.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.25 
 
 		 927 aa  81.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.39 
 
 		 930 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  30.5 
 
 		 640 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  30.08 
 
 		 636 aa  80.1  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  30.24 
 
 		 652 aa  79.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  30 
 
 		 754 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  29.58 
 
 		 669 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.81 
 
 		 957 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  29.51 
 
 		 644 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>