More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0075 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
540 aa  1051    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.98 
 
 
559 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 
615 aa  352  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 
589 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 
578 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 
605 aa  332  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  39.47 
 
 
589 aa  329  8e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  41.07 
 
 
616 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  41.07 
 
 
616 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  39.29 
 
 
601 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 
616 aa  326  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  37.57 
 
 
607 aa  323  6e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  38.89 
 
 
590 aa  322  8e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
611 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 
601 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 
605 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  38.64 
 
 
596 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 
627 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 
566 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
611 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 
581 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
563 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 
599 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
549 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  40.34 
 
 
605 aa  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 
602 aa  293  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 
597 aa  293  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 
564 aa  293  8e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.2 
 
 
592 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
574 aa  266  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 
572 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  37.48 
 
 
572 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  37.29 
 
 
572 aa  253  7e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
550 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.35 
 
 
577 aa  249  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
529 aa  240  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
501 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
525 aa  226  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
538 aa  133  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  30.26 
 
 
477 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  32.91 
 
 
483 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  32.91 
 
 
483 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  32.91 
 
 
483 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.57 
 
 
466 aa  127  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2006  sensor histidine kinase  28.95 
 
 
719 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
641 aa  124  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  30.91 
 
 
477 aa  123  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  30.91 
 
 
477 aa  123  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  26.12 
 
 
491 aa  123  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0467  histidine kinase  35.91 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.928659  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  34.63 
 
 
346 aa  123  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  30.73 
 
 
472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  33.33 
 
 
483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2885  ATPase domain-containing protein  31.21 
 
 
462 aa  120  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466682 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
513 aa  120  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  34.13 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  33.88 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3919  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
750 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681981  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
473 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1622  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
723 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  33.83 
 
 
471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
462 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  31.66 
 
 
457 aa  118  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28.71 
 
 
456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1790  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
723 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0621858  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 
614 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  28.71 
 
 
463 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
639 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
439 aa  116  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  31.36 
 
 
473 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  27.96 
 
 
463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2519  histidine kinase  26.02 
 
 
728 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
489 aa  116  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  30.55 
 
 
475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
815 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  30.43 
 
 
478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  30.33 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  28.29 
 
 
463 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0720  sensory box histidine kinase  30.38 
 
 
449 aa  115  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  27.32 
 
 
467 aa  115  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  35.18 
 
 
566 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
606 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
719 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
640 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
612 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
469 aa  114  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  28.22 
 
 
464 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.41 
 
 
461 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>