65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_09520 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_09520  Bacterial RNase P class A  100 
 
 		 325 bp  644    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546213  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0039  RNA component of RNaseP  84.83 
 
 		 341 bp  131  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0961177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  83.51 
 
 		 316 bp  119  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0022  RNA component of RNaseP  92.05 
 
 		 345 bp  119  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0027  RNA component of RNaseP  82.54 
 
 		 326 bp  117  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0068  RNA component of RNaseP  81.64 
 
 		 338 bp  115  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.400378  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16640  Bacterial RNase P class A  85.35 
 
 		 299 bp  113  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0340654  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07210  bacterial RNase P class A  91.67 
 
 		 340 bp  111  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0038  RNA component of RNaseP  89.77 
 
 		 348 bp  103  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000786849  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0048  RNA component of RNaseP  90.24 
 
 		 333 bp  99.6  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.231595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0038  RNA component of RNaseP  84.14 
 
 		 354 bp  95.6  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0631532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0034  RNA component of RNaseP  89.02 
 
 		 339 bp  91.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15110  Bacterial RNase P class A  82.02 
 
 		 324 bp  85.7  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12130  Bacterial RNase P class A  80.79 
 
 		 317 bp  85.7  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0161879  normal  0.0949657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  87.06 
 
 		 356 bp  81.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  87.06 
 
 		 353 bp  81.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0035  RNA component of RNaseP  86.9 
 
 		 334 bp  79.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0025  RNA component of RNaseP  86.9 
 
 		 184 bp  79.8  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0036  rnpB RNA  81.22 
 
 		 337 bp  79.8  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  80.63 
 
 		 348 bp  79.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  81.38 
 
 		 301 bp  77.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  80.41 
 
 		 427 bp  77.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  86.75 
 
 		 328 bp  77.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  80.42 
 
 		 309 bp  73.8  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0045  RNA component of RNaseP  83.87 
 
 		 312 bp  65.9  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  82.07 
 
 		 328 bp  65.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0043    97.3 
 
 		 293 bp  65.9  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00678643  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  79.37 
 
 		 332 bp  63.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0034  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 306 bp  61.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    83.91 
 
 		 352 bp  61.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  83.91 
 
 		 352 bp  61.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  83.91 
 
 		 318 bp  61.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0051  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 345 bp  60  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000384072  normal  0.735401 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  83.95 
 
 		 308 bp  58  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  85.51 
 
 		 373 bp  58  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  90.91 
 
 		 339 bp  56  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GsrnpB1  sRNA  82.95 
 
 		 315 bp  56  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0067  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 382 bp  54  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0337579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4508  RNase P RNA component precursor RnpB  83.91 
 
 		 396 bp  54  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0026  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 326 bp  54  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0025  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 368 bp  54  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0017  RNA component of RNaseP  90.7 
 
 		 307 bp  54  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316864  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0059  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 343 bp  52  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0109691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0037  RNaseP RNA  94.12 
 
 		 347 bp  52  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0033  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 391 bp  52  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.408233  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0034  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 333 bp  50.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0944967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0033  RNA component of RNaseP  84.06 
 
 		 304 bp  50.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256591  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1382  Bacterial RNase P class A  93.94 
 
 		 312 bp  50.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1398  sRNA  93.94 
 
 		 422 bp  50.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0029  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 364 bp  50.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.830354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0051  RNA component of RNaseP  90.24 
 
 		 328 bp  50.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0071  RNA component of RNaseP  90.24 
 
 		 352 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0671798 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_r0013  RNA_RNaseP_classA  93.94 
 
 		 313 bp  50.1  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.336548  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0032  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 333 bp  50.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.148898 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0076  RNA component of RNaseP  90.24 
 
 		 352 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0034  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 333 bp  48.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0634985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0002  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 346 bp  48.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.269548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  90 
 
 		 354 bp  48.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0020  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 336 bp  48.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00784007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  82.14 
 
 		 369 bp  48.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0023    90 
 
 		 341 bp  48.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0216677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0085  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 358 bp  48.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162846  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0056  RNaseP RNA  91.43 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0002  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 237 bp  46.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0585787 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_rnpB  RNase P RNA component  91.43 
 
 		 326 bp  46.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>