More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2817 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
206 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  45.83 
 
 
207 aa  184  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  48.63 
 
 
209 aa  167  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  48.97 
 
 
217 aa  166  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.71 
 
 
201 aa  160  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  46.45 
 
 
193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  47.22 
 
 
190 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  49.46 
 
 
189 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  44.94 
 
 
190 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.44 
 
 
190 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  40.51 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  46.41 
 
 
194 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  45.86 
 
 
194 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  44.68 
 
 
188 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.75 
 
 
191 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  42.78 
 
 
189 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  44.94 
 
 
188 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  42.05 
 
 
198 aa  141  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  44.38 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 
215 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  43.02 
 
 
195 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  44.57 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  41.05 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  40.22 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  40.32 
 
 
190 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 
241 aa  111  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  34.62 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 
243 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 
203 aa  109  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  34.26 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  34.43 
 
 
239 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 
239 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1031  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  33.33 
 
 
249 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  34.36 
 
 
204 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 
247 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  31.92 
 
 
240 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.22 
 
 
369 aa  99  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  32.49 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.95 
 
 
378 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3183  phosphoglycerate mutase  31.92 
 
 
240 aa  92  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  31.9 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.5 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0839  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
240 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.76 
 
 
356 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.41 
 
 
378 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 
213 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.73 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.85 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.87 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  40 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 
391 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
440 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  31.94 
 
 
198 aa  79  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0462  Phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 
192 aa  79  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  34.2 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  29.12 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  31.05 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.61 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3656  phosphoglycerate mutase family protein  25.11 
 
 
277 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 
378 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  33.5 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  26.4 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.16 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  31.9 
 
 
383 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.81 
 
 
365 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.81 
 
 
365 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.81 
 
 
365 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  25.93 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  34.73 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.26 
 
 
203 aa  72  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  25.93 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.16 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  26.54 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  37.69 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  27.16 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>