73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1643 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1618  PAS fold-3  100 
 
 		 145 aa  303  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1643  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 145 aa  303  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1589  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 144 aa  258  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5727  putative PAS/PAC sensor protein  55.2 
 
 		 225 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1090  putative PAS/PAC sensor protein  45.31 
 
 		 228 aa  120  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5113  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  56.19 
 
 		 223 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5202  putative PAS/PAC sensor protein  56.19 
 
 		 223 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5493  putative PAS/PAC sensor protein  56.19 
 
 		 223 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0873  PAS fold-3 domain protein  41.13 
 
 		 238 aa  98.2  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.637627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5565  putative PAS/PAC sensor protein  38.89 
 
 		 222 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5273  putative PAS/PAC sensor protein  38.89 
 
 		 222 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5184  putative PAS/PAC sensor protein  38.89 
 
 		 222 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3447  putative PAS/PAC sensor protein  45.63 
 
 		 199 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.509002  normal  0.758938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4425  putative PAS/PAC sensor protein  42.06 
 
 		 235 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1403  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.32 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.478088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11970  RNA-binding protein with PAS domain  33.61 
 
 		 247 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.494422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  31.78 
 
 		 340 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1401  putative PAS/PAC sensor protein  32.14 
 
 		 216 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1288  sensory box protein  27.64 
 
 		 685 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4878  PAS fold-3 domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 		 1116 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0193  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.72 
 
 		 924 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0289682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1666  PAS sensor protein  34.12 
 
 		 341 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  hitchhiker  0.00438569 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.25 
 
 		 958 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3244  putative PAS/PAC sensor protein  27.17 
 
 		 229 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0100  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.67 
 
 		 241 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 1596 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3029  putative PAS/PAC sensor protein  32.88 
 
 		 274 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 1047 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 		 1273 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2689  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 624 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 823 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1289 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1617  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.18 
 
 		 860 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.18 
 
 		 860 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.711633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 484 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 1300 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 3706 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1303  transcriptional regulator, LuxR family  29.49 
 
 		 442 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 785 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3414  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 673 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0560  putative PAS/PAC sensor protein  27.47 
 
 		 244 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4859  PAS domain-containing protein  30.85 
 
 		 338 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5345  PAS fold-3 domain protein  29.81 
 
 		 338 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.929152 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 		 869 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.84 
 
 		 954 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.993227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5399  PAS sensor protein  28.85 
 
 		 338 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.68 
 
 		 572 aa  43.5  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.12 
 
 		 1070 aa  43.5  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 695 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 665 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 918 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  23.02 
 
 		 1099 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3293  putative PAS/PAC sensor protein  37.25 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 1350 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.78 
 
 		 1124 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 712 aa  42  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 688 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 1118 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 936 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.89 
 
 		 1965 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  29.76 
 
 		 1248 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 		 745 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3063  diguanylate cyclase  29.7 
 
 		 1003 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.38 
 
 		 696 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2666  putative sensor protein  23 
 
 		 1129 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0600  putative PAS/PAC sensor protein  26.88 
 
 		 727 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000188746  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 945 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  23.08 
 
 		 2279 aa  40.4  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 512 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 865 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0528  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.99 
 
 		 707 aa  40  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 		 1122 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>