More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3847 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  44.41 
 
 		 759 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.84 
 
 		 784 aa  672    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.49 
 
 		 770 aa  671    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  46.53 
 
 		 732 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  47.42 
 
 		 736 aa  679    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  44.58 
 
 		 754 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  48.66 
 
 		 740 aa  710    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  48.05 
 
 		 775 aa  656    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  48.07 
 
 		 712 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  48.8 
 
 		 727 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  45.78 
 
 		 746 aa  636    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.43 
 
 		 741 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.28 
 
 		 732 aa  702    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  49.93 
 
 		 736 aa  669    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  47.28 
 
 		 736 aa  675    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  83.31 
 
 		 741 aa  1272    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  46.74 
 
 		 741 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  52.82 
 
 		 621 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  61.84 
 
 		 749 aa  908    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  44.52 
 
 		 755 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  49.39 
 
 		 750 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.86 
 
 		 737 aa  688    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  50.27 
 
 		 740 aa  681    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  47.48 
 
 		 716 aa  657    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  46.79 
 
 		 728 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  47.4 
 
 		 764 aa  674    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.99 
 
 		 785 aa  674    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  47.31 
 
 		 749 aa  704    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  47.09 
 
 		 743 aa  663    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6322  glycogen branching enzyme  48.64 
 
 		 733 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529539  normal  0.166008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  50.07 
 
 		 728 aa  698    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  47.97 
 
 		 735 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  45.84 
 
 		 764 aa  643    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  46.13 
 
 		 765 aa  647    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  53.8 
 
 		 638 aa  648    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  50.42 
 
 		 726 aa  721    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  50.16 
 
 		 634 aa  639    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  44.52 
 
 		 754 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  46.23 
 
 		 774 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  48.92 
 
 		 746 aa  698    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  46.09 
 
 		 745 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  48.16 
 
 		 768 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  50.2 
 
 		 728 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  50.34 
 
 		 740 aa  707    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.52 
 
 		 728 aa  735    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  48.33 
 
 		 834 aa  661    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  64 
 
 		 812 aa  921    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  49.38 
 
 		 716 aa  668    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.13 
 
 		 760 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  48.8 
 
 		 727 aa  647    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  51.36 
 
 		 625 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  46.57 
 
 		 729 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  44.65 
 
 		 755 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  48.21 
 
 		 716 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  49.45 
 
 		 725 aa  674    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  46.75 
 
 		 763 aa  674    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  49.31 
 
 		 716 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  48.07 
 
 		 712 aa  662    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  47.88 
 
 		 716 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  46.01 
 
 		 743 aa  646    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  49.39 
 
 		 736 aa  663    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  99.6 
 
 		 759 aa  1551    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  49.31 
 
 		 722 aa  681    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  50.21 
 
 		 748 aa  693    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.87 
 
 		 1217 aa  635    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  100 
 
 		 759 aa  1555    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  48.92 
 
 		 725 aa  665    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  50.27 
 
 		 738 aa  697    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  49.93 
 
 		 728 aa  689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.42 
 
 		 728 aa  668    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  59.1 
 
 		 732 aa  852    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  79.42 
 
 		 731 aa  1204    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.43 
 
 		 747 aa  642    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  45.35 
 
 		 776 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  47.69 
 
 		 736 aa  684    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  46.35 
 
 		 736 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  52.77 
 
 		 695 aa  688    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  63.28 
 
 		 755 aa  898    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5592  glycogen branching enzyme  48.85 
 
 		 733 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  46.14 
 
 		 743 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  47.06 
 
 		 732 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  48.3 
 
 		 732 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  0.0000652942 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  59.04 
 
 		 1224 aa  846    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  49.26 
 
 		 736 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  45.25 
 
 		 756 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  47.42 
 
 		 736 aa  676    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  46.62 
 
 		 723 aa  650    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  48.05 
 
 		 728 aa  682    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 727 aa  659    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  62.24 
 
 		 727 aa  919    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  50.48 
 
 		 731 aa  701    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  56.06 
 
 		 749 aa  823    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.54 
 
 		 841 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  99.6 
 
 		 759 aa  1551    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  48.66 
 
 		 727 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  84.99 
 
 		 737 aa  1280    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.5 
 
 		 631 aa  652    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  54.91 
 
 		 640 aa  675    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  46.14 
 
 		 743 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  44.5 
 
 		 754 aa  640    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>