29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3168 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  100 
 
 
329 aa  662    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  52.83 
 
 
349 aa  345  6e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  52.74 
 
 
349 aa  332  6e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  38.06 
 
 
328 aa  202  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  33.53 
 
 
644 aa  179  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  35.88 
 
 
716 aa  172  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  30.26 
 
 
647 aa  156  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  31.74 
 
 
641 aa  149  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  31.72 
 
 
652 aa  136  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  27.73 
 
 
660 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  29.11 
 
 
802 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  29.76 
 
 
290 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  25.62 
 
 
807 aa  122  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  31.65 
 
 
715 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  31.25 
 
 
536 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  30 
 
 
625 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  30.17 
 
 
601 aa  114  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  27.03 
 
 
610 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  27.05 
 
 
684 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  25.59 
 
 
697 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  29.88 
 
 
625 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  26.58 
 
 
450 aa  97.1  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  25.4 
 
 
678 aa  95.9  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  27.13 
 
 
679 aa  89.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  23.66 
 
 
680 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  24.03 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  20.91 
 
 
604 aa  56.6  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  25.68 
 
 
615 aa  46.2  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  22.36 
 
 
590 aa  44.3  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>