98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0685 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  100 
 
 
627 aa  1271    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  51 
 
 
615 aa  587  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  38.49 
 
 
635 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  36.19 
 
 
647 aa  363  6e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  36.88 
 
 
635 aa  360  3e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  36.79 
 
 
642 aa  351  2e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  35.37 
 
 
627 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  34.98 
 
 
644 aa  346  7e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  35.05 
 
 
638 aa  345  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  36.31 
 
 
657 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  35.78 
 
 
622 aa  343  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  34.32 
 
 
650 aa  342  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  33.85 
 
 
652 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  33.7 
 
 
630 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  33.67 
 
 
612 aa  307  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  33.66 
 
 
612 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  31.94 
 
 
618 aa  303  7.000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  33.88 
 
 
614 aa  302  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  37.09 
 
 
535 aa  300  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  33.33 
 
 
608 aa  300  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  37.67 
 
 
529 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  29.57 
 
 
640 aa  293  8e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  29.62 
 
 
640 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  36.18 
 
 
521 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  29.54 
 
 
640 aa  281  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  29.54 
 
 
640 aa  281  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  32.23 
 
 
615 aa  277  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  31.92 
 
 
647 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  36.59 
 
 
512 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  32.05 
 
 
616 aa  269  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  30.71 
 
 
606 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  31.2 
 
 
592 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  31.06 
 
 
592 aa  263  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  30.25 
 
 
610 aa  258  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  30.47 
 
 
592 aa  256  7e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  31.09 
 
 
558 aa  256  8e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  31.88 
 
 
611 aa  253  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  36.85 
 
 
537 aa  252  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  30.11 
 
 
605 aa  249  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  29.92 
 
 
821 aa  248  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  30.77 
 
 
694 aa  248  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  30.84 
 
 
598 aa  246  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  30.7 
 
 
581 aa  243  6e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  28.14 
 
 
683 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  30.42 
 
 
570 aa  231  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  28.9 
 
 
690 aa  226  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  29.42 
 
 
539 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  29.27 
 
 
673 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  31.08 
 
 
612 aa  220  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  29.27 
 
 
673 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  28.46 
 
 
679 aa  218  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  29.11 
 
 
673 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  29 
 
 
549 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  28.08 
 
 
538 aa  164  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  30.39 
 
 
426 aa  156  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  30.62 
 
 
417 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  29.62 
 
 
427 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  30.38 
 
 
417 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  32.04 
 
 
555 aa  146  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  32.67 
 
 
410 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  28.19 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  28.24 
 
 
534 aa  127  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  27.55 
 
 
424 aa  124  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  26.85 
 
 
685 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  25.68 
 
 
540 aa  97.8  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25 
 
 
554 aa  97.1  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  27.49 
 
 
514 aa  96.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26 
 
 
540 aa  93.2  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  25.9 
 
 
499 aa  91.7  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  26.38 
 
 
541 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  24.94 
 
 
539 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.61 
 
 
639 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.96 
 
 
535 aa  74.3  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  23.24 
 
 
530 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.33 
 
 
353 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1704  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  32.58 
 
 
352 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59364  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3633  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.48 
 
 
341 aa  47.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.94 
 
 
408 aa  47.8  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.36 
 
 
337 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_002620  TC0116  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.49 
 
 
431 aa  47.4  0.0009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  30.68 
 
 
336 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2791  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.29 
 
 
354 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  32.26 
 
 
353 aa  46.2  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.33 
 
 
372 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2280  phenol hydrolase reductase  29.22 
 
 
352 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32110  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer component  28.41 
 
 
337 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2966  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  28.41 
 
 
337 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.71 
 
 
356 aa  45.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.241657  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  47.83 
 
 
553 aa  45.8  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  33.33 
 
 
410 aa  45.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  41.18 
 
 
362 aa  44.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  35.62 
 
 
558 aa  44.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2708  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.68 
 
 
337 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102061 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.29 
 
 
357 aa  44.3  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.68 
 
 
336 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.831402  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.53 
 
 
407 aa  43.9  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.09 
 
 
339 aa  43.9  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  38.89 
 
 
320 aa  43.9  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>