More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3050 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3050  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 295 aa  589  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325921  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3477  short chain dehydrogenase  85.57 
 
 		 292 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3164  short chain dehydrogenase  68.75 
 
 		 291 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12160  short chain dehydrogenase  67.24 
 
 		 293 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.223019  normal  0.712287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3152  short chain dehydrogenase  68.75 
 
 		 294 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3214  short chain dehydrogenase  68.75 
 
 		 294 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38260  short-chain alcohol dehydrogenase  43.17 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.82 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1700  short chain dehydrogenase  44.36 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5212  short chain dehydrogenase  43.33 
 
 		 348 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5300  short chain dehydrogenase  43.33 
 
 		 348 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5592  short chain dehydrogenase  43.33 
 
 		 348 aa  175  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.23191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.39 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.12 
 
 		 289 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.07 
 
 		 289 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 275 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.98 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.73 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  40.53 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.71 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.71 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.71 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 		 267 aa  122  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 270 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 		 236 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.35 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.73 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 		 245 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.6 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.88 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.06 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  35.76 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  33.65 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 264 aa  106  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3826  short chain dehydrogenase  31.43 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.273342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2249  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113674  decreased coverage  1.89116e-19 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  40.12 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.77 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  32.11 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.64 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 248 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 		 228 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.38 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  34.67 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  36.36 
 
 		 246 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>