More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1983 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1983  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
209 aa  423  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.528796 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  68.5 
 
 
215 aa  271  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  45.23 
 
 
216 aa  157  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  40.48 
 
 
227 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  43.28 
 
 
229 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 
380 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  43.56 
 
 
231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  33.13 
 
 
445 aa  86.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  33.13 
 
 
445 aa  85.9  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  37.32 
 
 
525 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 
474 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  31.74 
 
 
445 aa  82.8  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  42.5 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  42.5 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  42.5 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  34.72 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  36.17 
 
 
527 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  33.53 
 
 
181 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  36.55 
 
 
198 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  34.72 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  38.73 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  40 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  35.25 
 
 
528 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  34.23 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  35.25 
 
 
528 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  35.92 
 
 
534 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  38.05 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  37.68 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  35.21 
 
 
537 aa  75.9  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  32.41 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  32.41 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  35.21 
 
 
534 aa  75.5  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  35.21 
 
 
534 aa  75.5  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  35.21 
 
 
534 aa  75.1  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  35.21 
 
 
537 aa  75.1  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  35.21 
 
 
534 aa  75.1  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  38.64 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  40.71 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  33.33 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  35.21 
 
 
534 aa  75.1  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  43.93 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  34.53 
 
 
511 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  33.65 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5704  resolvase domain-containing protein  32.41 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  34.23 
 
 
568 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  37.33 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  36.05 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  39.02 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  32.64 
 
 
522 aa  72.4  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  37.75 
 
 
203 aa  72  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  33.55 
 
 
544 aa  72  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  30.13 
 
 
447 aa  72  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  36.03 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  34.33 
 
 
293 aa  71.6  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  35.04 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  29.2 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  34.33 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  33.33 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  41.53 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  34.48 
 
 
545 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  31.54 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  31.54 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  33.33 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  32.88 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  37.17 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  33.12 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  33.09 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  33.1 
 
 
525 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  35.97 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  33.1 
 
 
525 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  36.81 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  36.81 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  36.81 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  36.21 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  43.56 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  43.69 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  32.86 
 
 
506 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  36.73 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  32.3 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  40.57 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.34 
 
 
515 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  27.68 
 
 
522 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  32.03 
 
 
532 aa  68.9  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  37.82 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  38.64 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  41.58 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3748  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57685  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  39.29 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  37.98 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  37.98 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  33.58 
 
 
298 aa  68.6  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.13 
 
 
415 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  32.37 
 
 
443 aa  68.6  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  32 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  41.58 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.33 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  27.36 
 
 
462 aa  68.2  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  37.72 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  38.84 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>