58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0364 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  73.56 
 
 		 211 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  60.7 
 
 		 205 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  61 
 
 		 208 aa  255  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 205 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 205 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 197 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 197 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 197 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  43.65 
 
 		 204 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 202 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 202 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 202 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2465  transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2232  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.347192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4113  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185648  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  32.75 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  26.78 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  36 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  28.16 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 243 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4652  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104872  hitchhiker  0.00491998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 235 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 235 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 235 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 195 aa  42  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 234 aa  42  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 271 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 205 aa  42  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 200 aa  41.6  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
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